Azaftalocyaniny jako nová skupina zhášečů fluorescence

Abstract

1 SOUHRN Tato disertační práce se zabývá hledáním strukturně nových potenciálních nefluoreskujících zhášečů fluorescence, použitelných pro přípravu molekulárních sond. Tyto potenciální zhášeče jsou odvozeny od nesymetricky substituovaných alkylaminoderivátů tetrapyrazinoporfyrazinů - azaftalocyaninů. Součástí práce je také příprava prekurzorů - 5,6- disubstituovaných pyrazin-2,3-dikarbonitrilů. Z nich byly připraveny finální sloučeniny - azaftalocyaniny obsahující různé funkční skupiny (hydroxy- a karboxyskupiny). Celkem bylo připraveno: 14 meziproduktů (z toho 3 dříve popsané na našem pracovišti) 13 finálních azaftalocyaninů (z toho 1 dříve popsán na našem pracovišti) 1 modifikovaná pevná fáze vhodná pro syntézu značeného oligonukleotidy 2 vedlejší produkty Podařilo se připravit 23 dosud nepopsaných sloučenin. Syntéza 4 sloučenin byla neúspěšná. Finální produkty byly testovány na produkci singletového kyslíku, stabilitu v roztocích používaných při syntéze oligonukleotidů a následně na schopnost zhášení fluorescence komerčně dostupného a často používaného fluoroforu Cy5® v porovnání s komerčně dostupným zhášečem Black Hole Quencher-2® . Součástí této práce bylo také ověření rozložení zastoupení jednotlivých kongenerů vznikajících při statistické tetramerizace prekurzorů pomocí metody HPLC s UV-vis detekcí....

1 SUMMARY This dissertation thesis deals with searching of structurally new non-fluorescent quenchers of fluorescence, which may be used for preparation of molecular probes. These potential quenchers are derived from asymmetrically substituted alkylaminoderivatives of tetrapyrazinoporphyrazines - azaphthalocyanines. As the part of this work is preparation of precursors - 5,6-disubstituted pyrazine-2,3-dicarbonitriles. They are starting material for the preparation of final substances - tetrapyrazinoporphyrazines bearing different functional moieties. In total were prepared: 14 intermediates (3 of them have been described in our department) 13 final tetrapyrazinoporphyrazines (1 of them has been described in our department) 1 modified solid phase suitable for synthesis of marked oligonucleotides 2 by-products 23 undescribed compounds were prepared. Synthesis of 4 substances was not successful. Final products were tested for their singlet oxygen quantum yields, stability in solutions used for synthesis of oligonucleotides and subsequently ability of quenching of commercially available fluorofor Cy5® . This ability was compared with commercially available quencher Black Hole Quencher-2® . As a part of this work is confirmation of distribution of congeners arising during the statistical tetramerization of...