Mechanisms of membrane protein quality control in the endoplasmic reticulum
Mechanismy kontroly kvality membránových proteinů v endoplasmatickém retikulu
bakalářská práce (OBHÁJENO)

Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/190254Identifikátory
SIS: 267108
Kolekce
- Kvalifikační práce [20486]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Bařinka, Cyril
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Molekulární biologie a biochemie organismů
Katedra / ústav / klinika
Katedra genetiky a mikrobiologie
Datum obhajoby
4. 6. 2024
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Angličtina
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
membránový protein, kontrola kvality proteinů, translokace, sbalování, degradace, ERADKlíčová slova (anglicky)
membrane protein, protein quality control, translocation, folding, degradation, ERADIntegrální membránové proteiny (IMP) procházejí rozsáhlou kontrolou kvality (QC) v endoplazmatickém retikulu (ER), aby se udržela proteostáza a integrita proteomu ER. Ribosomální kontrola kvality proteinů asociovaná s ER (ER-ribosome-associated protein quality control; ER-RQC) reaguje na zastavení ribozomů během translokace a pomáhá uvolnit ucpaný translokon. Degradace proteinů asociovaná s ER (ER-associated degradation; ERAD) cílí špatně sbalené IMP k proteasomální degradaci. IMP odolné vůči ERAD jsou degradovány pomocí různých ER-fagických drah, souhrně označovaných jako ELRAD (ER-to-lysosome associated degradation). Koordinaci těchto mechanismů zajišťuje odpověď na špatně sbalené proteiny (unfolded protein response, UPR), ačkoli receptory UPR nejsou s největší pravděpodobností aktivovány aberantními IMP, protože všechny tyto mechanismy fungují i jako mechanismy kontroly kvality ER-luminárních proteinů.
Integral membrane proteins (IMPs) undergo extensive quality control (QC) within the endoplasmic reticulum (ER) to maintain ER proteostasis and the integrity of the ER proteome. ER-associated ribosome quality control (ER-RQC) responds to ribosome stalls during translocation and helps "de-clog" blocked translocon. ER-associated degradation (ERAD) targets misfolded IMPs for proteasomal degradation. ERAD-resistant IMPs are degraded by different ER-phagic pathways, collectively referred to as ELRAD (ER-to-lysosome associated degradation). Coordination of these mechanisms is facilitated by the unfolded protein response (UPR), although UPR receptors are most likely not activated by aberrant IMPs, as all these mechanisms function in the QC of ER-luminal proteins.