Show simple item record

The role of gene AHL20 in initiation and development of lateral roots.
dc.contributor.advisorSoukup, Aleš
dc.creatorSvobodová, Barbora
dc.date.accessioned2023-11-07T00:21:09Z
dc.date.available2023-11-07T00:21:09Z
dc.date.issued2023
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/185472
dc.description.abstractMembers of the AHL (AT-hook motif nuclear-localized) gene family have been found in all sequenced plant land species, hence a link between divergence of AHL genes and colonization of terrestrial environments by plants is assumed. One of the adaptations of plants to the terrestrial environment was the development of a root system. Currently there is only a few information about the possible function of AHL genes in root system establishment and development. A typical characteristic of AHL genes is the presence of an AT-hook motif and a highly conserved PPC domain. Many studies have confirmed the involvement of AHL genes in a wide range of plant processes. They are potentially strong regulators of transcription at different levels. They function as transcription factors, interact with other transcription factors through the PPC domain, and are capable of chromatin remodeling through histone modifications. We selected candidate genes based on publicly available transcriptomic data: AHL18, AHL19, AHL20, AHL21, AHL22, AHL23, AHL27, and AHL28 with predicted function in root formation and development. The first aim of this thesis was to investigate possible involvement of AHL genes in lateral root development. For AHL19, AHL20, AHL21, AHL23, AHL27, and AHL28, we examined transcription rates at the root...en_US
dc.description.abstractČlenové genové rodiny AHL (AT-hook motif nuclear-localized) byli nalezeni ve všech doposud osekvenovaných suchozemských rostlinách; z tohoto důvodu se předpokládá souvislost mezi divergencí AHL genů a kolonizací suchozemského prostředí rostlinami. Jednou z adaptací rostlin na suchozemské prostředí byl vznik kořenového systému. O možné funkci AHL genů při vzniku a vývoji kořenové systému se toho momentálně mnoho neví. Typickou vlastností AHL genů je přítomnost AT-hook motivu a vysoce konzervované PPC domény. Mnoho studií potvrdilo jejich účast na široké škále rostlinných procesů. Jedná se o potenciálně silné regulátory transkripce na různých úrovních. Fungují jako transkripční faktory; prostřednictvím PPC domény interagují s dalšími transkripčními faktory a prostřednictvím modifikací histonů jsou schopni remodelace chromatinu. Na základě veřejně dostupných transkriptomických dat jsme vybrali kandidátní geny: AHL18, AHL19, AHL20, AHL21, AHL22, AHL23, AHL27 a AHL28 s predikcí funkce při vzniku a vývoji kořenového systému. Prvním cílem diplomové práce bylo zjistit jejich možné zapojení při vývoji postranních kořenů. U AHL19, AHL20, AHL21, AHL23, AHL27 a AHL28 jsme zkoumali míru transkripce v kořenové špičce a v různých stádiích vyvíjejících se primordií. Na základě získaných výsledků jsme poté vybrali...cs_CZ
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectiniciace postranních kořenůcs_CZ
dc.subjectprimordiumcs_CZ
dc.subjectkořenový systémcs_CZ
dc.subjectgenová rodina AHLcs_CZ
dc.subjectAHL20cs_CZ
dc.subjectlateral root initiationen_US
dc.subjectprimordiumen_US
dc.subjectroot systemen_US
dc.subjectgene family AHLen_US
dc.subjectAHL20en_US
dc.titleRole genu AHL20 při iniciaci a prorůstání postranních kořenů.cs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2023
dcterms.dateAccepted2023-09-14
dc.description.departmentKatedra experimentální biologie rostlincs_CZ
dc.description.departmentDepartment of Experimental Plant Biologyen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId243924
dc.title.translatedThe role of gene AHL20 in initiation and development of lateral roots.en_US
dc.contributor.refereeRůžička, Kamil
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineExperimentální biologie rostlin se specializací Fyziologie a anatomie rostlincs_CZ
thesis.degree.disciplineExperimental Plant Biology with specialisation in Plant Anatomy and Physiologyen_US
thesis.degree.programExperimentální biologie rostlincs_CZ
thesis.degree.programExperimental Plant Biologyen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra experimentální biologie rostlincs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Experimental Plant Biologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csExperimentální biologie rostlin se specializací Fyziologie a anatomie rostlincs_CZ
uk.degree-discipline.enExperimental Plant Biology with specialisation in Plant Anatomy and Physiologyen_US
uk.degree-program.csExperimentální biologie rostlincs_CZ
uk.degree-program.enExperimental Plant Biologyen_US
thesis.grade.csVelmi dobřecs_CZ
thesis.grade.enVery gooden_US
uk.abstract.csČlenové genové rodiny AHL (AT-hook motif nuclear-localized) byli nalezeni ve všech doposud osekvenovaných suchozemských rostlinách; z tohoto důvodu se předpokládá souvislost mezi divergencí AHL genů a kolonizací suchozemského prostředí rostlinami. Jednou z adaptací rostlin na suchozemské prostředí byl vznik kořenového systému. O možné funkci AHL genů při vzniku a vývoji kořenové systému se toho momentálně mnoho neví. Typickou vlastností AHL genů je přítomnost AT-hook motivu a vysoce konzervované PPC domény. Mnoho studií potvrdilo jejich účast na široké škále rostlinných procesů. Jedná se o potenciálně silné regulátory transkripce na různých úrovních. Fungují jako transkripční faktory; prostřednictvím PPC domény interagují s dalšími transkripčními faktory a prostřednictvím modifikací histonů jsou schopni remodelace chromatinu. Na základě veřejně dostupných transkriptomických dat jsme vybrali kandidátní geny: AHL18, AHL19, AHL20, AHL21, AHL22, AHL23, AHL27 a AHL28 s predikcí funkce při vzniku a vývoji kořenového systému. Prvním cílem diplomové práce bylo zjistit jejich možné zapojení při vývoji postranních kořenů. U AHL19, AHL20, AHL21, AHL23, AHL27 a AHL28 jsme zkoumali míru transkripce v kořenové špičce a v různých stádiích vyvíjejících se primordií. Na základě získaných výsledků jsme poté vybrali...cs_CZ
uk.abstract.enMembers of the AHL (AT-hook motif nuclear-localized) gene family have been found in all sequenced plant land species, hence a link between divergence of AHL genes and colonization of terrestrial environments by plants is assumed. One of the adaptations of plants to the terrestrial environment was the development of a root system. Currently there is only a few information about the possible function of AHL genes in root system establishment and development. A typical characteristic of AHL genes is the presence of an AT-hook motif and a highly conserved PPC domain. Many studies have confirmed the involvement of AHL genes in a wide range of plant processes. They are potentially strong regulators of transcription at different levels. They function as transcription factors, interact with other transcription factors through the PPC domain, and are capable of chromatin remodeling through histone modifications. We selected candidate genes based on publicly available transcriptomic data: AHL18, AHL19, AHL20, AHL21, AHL22, AHL23, AHL27, and AHL28 with predicted function in root formation and development. The first aim of this thesis was to investigate possible involvement of AHL genes in lateral root development. For AHL19, AHL20, AHL21, AHL23, AHL27, and AHL28, we examined transcription rates at the root...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra experimentální biologie rostlincs_CZ
thesis.grade.code2
dc.contributor.consultantMartinčová, Michaela
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusO


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV