Analýza metabolitů produkovaných kvasinkovými koloniemi a biofilmy

Abstract

U bakterií je již delší dobu popsán fenomén signalizace pomocí malých molekul, tzv. quorum sensing. Tento fenomén byl v poměrně nedávné době popsán i u kvasinek, ovšem stále zůstává otevřena celá řada otázek ohledně signalizace pomocí malých molekul u kvasinek. Několik prací a publikací již popsalo vliv některých nízkomolekulárních látek jako například fenylethylalkoholu nebo tryptofolu na morfologii buněk S. cerevisiae. Ovšem o vlivu nízkomolekulárních látek na morfologii mnohobuněčného společenství kvasinek, jakými jsou i kolonie, je toho známo velmi málo. Cíle této práce jsou, za přístupu neselektivní metabolomiky, analyzovat jaké metabolity jsou produkovány různými kmeny S. cerevisiae při kultivaci na různých typech pevných komplexních medií. Na základě výsledků analýzy metabolitů bude testován vliv vybraných látek na morfologii mikrokolonií S. cerevisiae při kultivaci na pevném komplexním mediu. Třetí část práce pak popisuje přípravu klonů, u kterých došlo ke genovým manipulacím za účelem ovlivnit fungování Ehrlichovy dráhy, která je zodpovědná za produkci některých metabolitů, která dokáží ovlivnit morfologii kolonií S. cerevisiae. Klíčová slova: Saccharomyces cerevisiae, mikrokolonie, tryptofol, isoamyl alkohol, kyselina isovalerová, morfologie kolonií, strukturované mikrokolonie, hladké...

Some time ago it was shown (proved, described) that bacteria can communicate and regulate a gene expression by using small molecules. This phenomenon is called quorum sensing. The same phenomenon has been recently described in yeast. In yeast there are still many questions about the mechanism of sensing via small molecules. Few works and publications have described the impact of some small molecules, such as phenylethylalcohol or tryptophol, on morphology on Saccharomyces cerevisiae cell. The knowledge about the impact of the small molecules on the yeast multicellular community, like colonies, is still very limited these days. The aims of this work are analysis of exometabolites produced by colonies of different yeast strains cultivated on various solid complex media, by an untarged metabolomic approach. In accordance with the result of the exometabolites analyses we are going to test the impact of the selected substance on Saccharomyces cerevisiae colony morphology. The third part of this work is about the construction of Saccharomyces cerevisiae strains with deletion or lowering the expression of genes which encode proteins that are important in decarboxylation step of the Ehrlich pathway. Key word: Saccharomyces cerevisiae, microcolonies, tryptophol, isoamyl alcohol, isovaleric acid, colony...