Fungal Microbiota and Inflammatory Bowel Disease

Abstract

Inflammatory bowel disease (IBD) is a term for the gastrointestinal tract's chronic inflammatory disorders, evincing growing worldwide prevalence. Commonly, IBD is divided into two major subgroups, Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC). Despite intensive efforts, IBD etiology and development mechanisms are not fully understood. Gut barrier dysfunction, dysbiosis, and overreactive immune response to gut microbiota appear to have a significant impact. While bacteria are the most studied gut inhabitants, research on the role of fungal microbiota (mycobiota) in IBD lags behind. This diploma thesis aimed to study immune responses to gut mycobiota in IBD. Levels of antifungal antibodies against gut residents and biomarkers relevant to gut barrier damage and microbial translocation were measured in the sera of IBD patients and healthy individuals. Sera of individuals diagnosed with UC, CD, and IBD associated with primary sclerosing cholangitis (PSC-IBD) were used. Since continuous intestinal macrophage activation is a feature of IBD, the effect of selected fungal mycobiota species on the reactivity of peripheral blood-derived macrophages from healthy donors was assessed in vitro. The levels of serum antibodies against mycobiota components were higher in IBD patients than in controls, and the...

Idiopatický črevný zápal (IČZ) je termín označujúci chronické zápalové ochorenia tráviaceho traktu preukazujúce rastúcu svetovú prevalenciu. Bežne sa IČZ delí na dve hlavné podskupiny, Crohnovu chorobu (CD) a ulceróznu kolitídu (UK). Napriek intenzívnym snahám stále nie sú plne objasnené mechanizmy etiológie a rozvoja IČZ. Zdá sa, že významný vplyv má porucha funkcie črevnej bariéry, dysbióza a nadmerná reaktivita imunitnej odpovede voči črevnej mikrobiote. Zatiaľ čo baktérie sú najviac študovanými obyvateľmi čriev, výskum roly fungálnej mikrobioty (mykobioty) v IČZ zaostáva. Táto diplomová práca sa zameriavala na štúdium imunitných odpovedí na črevnú mykobiotu v IČZ. Hladiny anti-fungálnych protilátok proti črevným rezidentom a hladiny biomarkerov relevantných pre poškodenie črevnej bariéry a mikrobiálnu translokáciu boli merané v sérach IČZ pacientov a zdravých jedincov. Boli použité séra jedincov s diagnostikovanou UK, CD a IČZ asociovaným s primárnou sklerotizujúcou cholangitídou (PSC-IČZ). Keďže neustála aktivácia črevných makrofágov je jednou z čŕt IČZ, bol hodnotený aj in vitro efekt vybraných druhov črevnej mykobioty na reaktivitu makrofágov derivovaných z periférnej krvi zdravých darcov. Hladiny sérových protilátok proti zložkám mykobioty boli vyššie u IČZ pacientov než u kontrol a...