Show simple item record

The impact of nucleophosmin gene mutations on its interaction potential
dc.contributor.advisorBrodská, Barbora
dc.creatorŠašinková, Markéta
dc.date.accessioned2022-07-25T14:22:50Z
dc.date.available2022-07-25T14:22:50Z
dc.date.issued2022
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/174785
dc.description.abstractNucleophosmin 1 (NPM1) is predominantly localized in the nucleolus and occurs mainly in oligomers formed through its N-terminal domain (NTD). As a transport facilitator and chaperone, NPM1 has a wide range of interacting partners including tumor suppressors p53 and p14Arf. Characteristic C-terminal mutations in NPM1 are reported in approximately 30 % of acute myeloid leukemia (AML) cases and cause aberrant cytoplasmic localization of mutated (mut) NPM1. As a result, many NPM1-interacting proteins, including wild type (wt) NPM1, are relocalized to the cytoplasm. In order to analyze interactions and the oligomeric state of NPM1, we have introduced and optimized several in vitro techniques - native and semi-native polyacrylamide gel electrophoresis and immunoprecipitation - as well as in vivo confocal microscopy and time-resolved fluorescence approaches. Using these methods, we revealed that mutations at the C-terminal domain of NPM1 prevent it from binding nucleolar protein nucleolin (NCL), which has previously been shown to interact with the central part of NPM1, and that drug-induced relocation of mutNPM1 to close proximity of NCL does not induce mutNPM1-NCL complex formation. We proved a lowered stability of mutNPM1-formed oligomers as compared to the wtNPM1 ones, which could be useful for NPM1...en_US
dc.description.abstractNukleofosmin 1 (NPM1; nucleophosmin 1) se v buňce vyskytuje převážně v jadérku, ve formě oligomerů tvořených skrze N-koncovou doménu (NTD; N-terminal domain), a jako molekulární chaperon a transportní protein má široké spektrum interakčních partnerů včetně p53 či p14Arf. Mutace v C-koncové oblasti NPM1 je prokazována asi u 30 % pacientů s akutní myeloidní leukémií (AML; acute myeloid leukemia) a projevuje se aberantní expresí mutovaného (mut; mutated) NPM1 v cytoplazmě. V důsledku toho dochází v leukemických buňkách s mutNPM1 k přesunu mnoha proteinů s ním interagujících, včetně jeho přirozené formy (wt; wild-type), do cytoplazmy. Pro detekci interakcí a oligomerních komplexů NPM1 jsme zavedli a optimalizovali jak in vitro techniky - nativní a seminativní gelovou elektroforézu a imunoprecipitaci, tak testování in vivo - konfokální mikroskopii a metody časově rozlišené fluorescence. Těmito metodami jsme prokázali, že v důsledku C-terminální mutace NPM1 dochází k narušení jeho interakce s jadérkovým proteinem nukleolinem (NCL; nucleolin), která se tvoří mimo NTD, a že komplex mutNPM1-NCL nevzniká ani po ošetření buněk cytotoxickými léčivy navozujícími relokalizaci obou partnerů do stejného buněčného kompartmentu. V naší studii dále ukazujeme, že oligomery mutNPM1 jsou méně stabilní než oligomery...cs_CZ
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.titleAnalýza vlivu mutací v genu pro nukleofosmin na jeho interakční potenciálcs_CZ
dc.typedizertační prácecs_CZ
dcterms.created2022
dcterms.dateAccepted2022-06-29
dc.description.departmentDepartment of Genetics and Microbiologyen_US
dc.description.departmentKatedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId182872
dc.title.translatedThe impact of nucleophosmin gene mutations on its interaction potentialen_US
dc.contributor.refereeČáp, Michal
dc.contributor.refereeStarková, Júlia
thesis.degree.namePh.D.
thesis.degree.leveldoktorskécs_CZ
thesis.degree.disciplineMolekulární a buněčná biologie, genetika a virologiecs_CZ
thesis.degree.disciplineMolecular and Cellular Biology, Genetics and Virologyen_US
thesis.degree.programMolecular and Cellular Biology, Genetics and Virologyen_US
thesis.degree.programMolekulární a buněčná biologie, genetika a virologiecs_CZ
uk.thesis.typedizertační prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Genetics and Microbiologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csMolekulární a buněčná biologie, genetika a virologiecs_CZ
uk.degree-discipline.enMolecular and Cellular Biology, Genetics and Virologyen_US
uk.degree-program.csMolekulární a buněčná biologie, genetika a virologiecs_CZ
uk.degree-program.enMolecular and Cellular Biology, Genetics and Virologyen_US
thesis.grade.csProspěl/acs_CZ
thesis.grade.enPassen_US
uk.abstract.csNukleofosmin 1 (NPM1; nucleophosmin 1) se v buňce vyskytuje převážně v jadérku, ve formě oligomerů tvořených skrze N-koncovou doménu (NTD; N-terminal domain), a jako molekulární chaperon a transportní protein má široké spektrum interakčních partnerů včetně p53 či p14Arf. Mutace v C-koncové oblasti NPM1 je prokazována asi u 30 % pacientů s akutní myeloidní leukémií (AML; acute myeloid leukemia) a projevuje se aberantní expresí mutovaného (mut; mutated) NPM1 v cytoplazmě. V důsledku toho dochází v leukemických buňkách s mutNPM1 k přesunu mnoha proteinů s ním interagujících, včetně jeho přirozené formy (wt; wild-type), do cytoplazmy. Pro detekci interakcí a oligomerních komplexů NPM1 jsme zavedli a optimalizovali jak in vitro techniky - nativní a seminativní gelovou elektroforézu a imunoprecipitaci, tak testování in vivo - konfokální mikroskopii a metody časově rozlišené fluorescence. Těmito metodami jsme prokázali, že v důsledku C-terminální mutace NPM1 dochází k narušení jeho interakce s jadérkovým proteinem nukleolinem (NCL; nucleolin), která se tvoří mimo NTD, a že komplex mutNPM1-NCL nevzniká ani po ošetření buněk cytotoxickými léčivy navozujícími relokalizaci obou partnerů do stejného buněčného kompartmentu. V naší studii dále ukazujeme, že oligomery mutNPM1 jsou méně stabilní než oligomery...cs_CZ
uk.abstract.enNucleophosmin 1 (NPM1) is predominantly localized in the nucleolus and occurs mainly in oligomers formed through its N-terminal domain (NTD). As a transport facilitator and chaperone, NPM1 has a wide range of interacting partners including tumor suppressors p53 and p14Arf. Characteristic C-terminal mutations in NPM1 are reported in approximately 30 % of acute myeloid leukemia (AML) cases and cause aberrant cytoplasmic localization of mutated (mut) NPM1. As a result, many NPM1-interacting proteins, including wild type (wt) NPM1, are relocalized to the cytoplasm. In order to analyze interactions and the oligomeric state of NPM1, we have introduced and optimized several in vitro techniques - native and semi-native polyacrylamide gel electrophoresis and immunoprecipitation - as well as in vivo confocal microscopy and time-resolved fluorescence approaches. Using these methods, we revealed that mutations at the C-terminal domain of NPM1 prevent it from binding nucleolar protein nucleolin (NCL), which has previously been shown to interact with the central part of NPM1, and that drug-induced relocation of mutNPM1 to close proximity of NCL does not induce mutNPM1-NCL complex formation. We proved a lowered stability of mutNPM1-formed oligomers as compared to the wtNPM1 ones, which could be useful for NPM1...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
thesis.grade.codeP
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusO


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2025 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV