Show simple item record

Inaktivace ICAM-1 genu metodou oligonukleotidů modifikovaných lysinem
dc.contributor.advisorŠtaud, František
dc.creatorKocourková, Aneta
dc.date.accessioned2017-04-11T12:03:25Z
dc.date.available2017-04-11T12:03:25Z
dc.date.issued2008
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/16186
dc.description.abstractV této studii se projevuje nadějná možnost zvýšení genové exprese konjugací ligandů na antisense oligonukleotidy a siRNA. Při modifikaci se využilo 2'-O-lysylaminohexylové skupiny vázané na uridinovou bazi, která nahradila jednu, dvě až tři baze thyminové. Uvedené záměny a modifikace bazí byly testovány pro zlepšení inhibice proteinové exprese. Efektivita modifikací v inhibici proteinové exprese byla zkoušena na alicaforsenové sekvenci (DNA) a siRNA. Alicaforsen, který se nachází ve třetí fázi klinické studie, je phosphorothioát komplementární k ICAM-1, siRNA, jenž nově prokázala afinitu k ICAM-1, čehož bylo využito při porovnání účinnosti výše zmíněných modifikací a objevení následných možností uplatnění alicaforsen a siRNA v terapii. Poprvé byla pozorována a prokázána down-regulace ICAM-1 na buněčné linii ECV304, která imituje prostředí hematoencefalické bariéry. Nemodifikované/modifikované sekvence oligonukleotidů a siRNA byly transfekovány do ECV304 buněk. Po 24 hodinové transfekci byly buňky rozrušeny chemickou lýzou. Koncentrace získaných proteinů byly stanoveny Bradford analýzou a následná inhibice ICAM-1 byla vyhodnocena western blotem. Hodnoty inhibicí byly standardizovány k odpovídajícímu aktinu a kontrolním buňkám. Vyhodnocení genové exprese proběhlo pomocí denzitometrie autoradiogramů a...cs_CZ
dc.description.abstractConjugation of ligands to antisense oligonucleotides is a promising approach for enhancing their effects on gene expression. In this study 2'-O-lysylaminohexyl group was linked to the uridine base, which replaces one, two or three thymine bases thus modifies the oligonucleotides. This exchange of bases was tested for improvement of silencing target protein expression. Effectivity of modifications in silencing target protein expression was examined with the alicaforsen sequence (DNA) and siRNA. Alicaforsen, currently in clinical trial 3, is a phosphorothioate targeting ICAM-1, which was the model used to evaluate the influence of modifications. The same target was chosen for siRNA to compare the efficiency of DNA and siRNA substances. For the first time, down-regulation of ICAM-1 was shown on the blood brain barrier cell line ECV304. Unmodified/modified antisense oligonucleotides and siRNA sequences were transfected into ECV304 cells with the help of a transfection agent lipofectamine 2000. After 24 hours of transfection cells were disrupted by a chemical lysis. Protein concentrations were determined by Bradford protein assay. ICAM-1 inhibition was assessed with western blot. The inhibitory effect of ICAM-1 was normalized to the corresponding actin and untreated cells. ICAM-1 protein levels were...en_US
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
dc.titleInaktivace ICAM-1 genu metodou oligonukleotidů modifikovaných lysinemen_US
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2008
dcterms.dateAccepted2008-06-03
dc.description.departmentKatedra farmakologie a toxikologiecs_CZ
dc.description.departmentDepartment of Pharmacology and Toxicologyen_US
dc.description.facultyFaculty of Pharmacy in Hradec Královéen_US
dc.description.facultyFarmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
dc.identifier.repId17788
dc.title.translatedInaktivace ICAM-1 genu metodou oligonukleotidů modifikovaných lysinemcs_CZ
dc.contributor.refereeNachtigal, Petr
dc.identifier.aleph000985085
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelmagisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineFarmaciecs_CZ
thesis.degree.disciplinePharmacyen_US
thesis.degree.programFarmaciecs_CZ
thesis.degree.programPharmacyen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csFarmaceutická fakulta v Hradci Králové::Katedra farmakologie a toxikologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Pharmacy in Hradec Králové::Department of Pharmacology and Toxicologyen_US
uk.faculty-name.csFarmaceutická fakulta v Hradci Královécs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Pharmacy in Hradec Královéen_US
uk.faculty-abbr.csFaFcs_CZ
uk.degree-discipline.csFarmaciecs_CZ
uk.degree-discipline.enPharmacyen_US
uk.degree-program.csFarmaciecs_CZ
uk.degree-program.enPharmacyen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csV této studii se projevuje nadějná možnost zvýšení genové exprese konjugací ligandů na antisense oligonukleotidy a siRNA. Při modifikaci se využilo 2'-O-lysylaminohexylové skupiny vázané na uridinovou bazi, která nahradila jednu, dvě až tři baze thyminové. Uvedené záměny a modifikace bazí byly testovány pro zlepšení inhibice proteinové exprese. Efektivita modifikací v inhibici proteinové exprese byla zkoušena na alicaforsenové sekvenci (DNA) a siRNA. Alicaforsen, který se nachází ve třetí fázi klinické studie, je phosphorothioát komplementární k ICAM-1, siRNA, jenž nově prokázala afinitu k ICAM-1, čehož bylo využito při porovnání účinnosti výše zmíněných modifikací a objevení následných možností uplatnění alicaforsen a siRNA v terapii. Poprvé byla pozorována a prokázána down-regulace ICAM-1 na buněčné linii ECV304, která imituje prostředí hematoencefalické bariéry. Nemodifikované/modifikované sekvence oligonukleotidů a siRNA byly transfekovány do ECV304 buněk. Po 24 hodinové transfekci byly buňky rozrušeny chemickou lýzou. Koncentrace získaných proteinů byly stanoveny Bradford analýzou a následná inhibice ICAM-1 byla vyhodnocena western blotem. Hodnoty inhibicí byly standardizovány k odpovídajícímu aktinu a kontrolním buňkám. Vyhodnocení genové exprese proběhlo pomocí denzitometrie autoradiogramů a...cs_CZ
uk.abstract.enConjugation of ligands to antisense oligonucleotides is a promising approach for enhancing their effects on gene expression. In this study 2'-O-lysylaminohexyl group was linked to the uridine base, which replaces one, two or three thymine bases thus modifies the oligonucleotides. This exchange of bases was tested for improvement of silencing target protein expression. Effectivity of modifications in silencing target protein expression was examined with the alicaforsen sequence (DNA) and siRNA. Alicaforsen, currently in clinical trial 3, is a phosphorothioate targeting ICAM-1, which was the model used to evaluate the influence of modifications. The same target was chosen for siRNA to compare the efficiency of DNA and siRNA substances. For the first time, down-regulation of ICAM-1 was shown on the blood brain barrier cell line ECV304. Unmodified/modified antisense oligonucleotides and siRNA sequences were transfected into ECV304 cells with the help of a transfection agent lipofectamine 2000. After 24 hours of transfection cells were disrupted by a chemical lysis. Protein concentrations were determined by Bradford protein assay. ICAM-1 inhibition was assessed with western blot. The inhibitory effect of ICAM-1 was normalized to the corresponding actin and untreated cells. ICAM-1 protein levels were...en_US
uk.publication.placeHradec Královécs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, Katedra farmakologie a toxikologiecs_CZ
dc.identifier.lisID990009850850106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV