Show simple item record

Entropie a nevratnost přechodů přes energetické bariéry
dc.contributor.advisorRyabov, Artem
dc.creatorPajger, Šimon
dc.date.accessioned2021-10-05T10:39:29Z
dc.date.available2021-10-05T10:39:29Z
dc.date.issued2021
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/149235
dc.description.abstractTitle: Entropy production and irreversibility in transition state theory Author: Šimon Pajger Department: Department of Macromolecular Physics Supervisor: RNDr. Artem Ryabov, Ph.D., Department of Macromolecular Physics Abstract: Modern experiments focusing on durations of nonequilibrium transi- tions provide valuable information on the underlying microscopic kinetics. Theo- retically, outcomes of such experiments are well understood for time-independent free energy landscapes only. Amongst the most fundamental results in this area belongs an identity of distributions of times of forward and backward transitions between arbitrary two points of a free energy landscape. However, recently it has been experimentally found, that this identity can be broken by an action of external time-dependent force. In the thesis, we explore this situation theo- retically and discuss under which conditions the identity of distributions can be restored. To this end, we introduce distributions of transition times weighted by the entropy production. In particular, we show that it is possible to find weight for each trajectory, such that weighted distributions of transition times resulting from such weights are identical. Assuming an external harmonic time-dependent force, we discuss two experimentally relevant situations. First,...en_US
dc.description.abstractNázev práce: Entropie a nevratnost přechodů přes energetické bariéry Autor: Šimon Pajger Katedra: Katedra makromolekulární fyziky Vedoucí bakalářské práce: RNDr. Artem Ryabov, Ph.D., Katedra makromolekulární fyziky Abstrakt: Moderní experimenty zaměřené na studium dob trvání nerovnovážných přechodových dejů poskytují cenné informace o mikroskopické dynamice těchto procesů. Teoreticky jsou výsledky takových experimentů dobře popsány pouze pro systémy, na něž nepůsobí časově závislá vnější síla, kde jednou z nejobecnějších teoretických předpovědí je tvrzení o rovnosti distribucí časů přechodů dopředu a zpět mezi libovolnými dvěma body krajiny volné energie. Nedávno však bylo experimentálně zjištěno, že tato identita může být narušena působením vnější časově závislé síly. V práci teoreticky zkoumáme tuto situaci a diskutujeme, za jakých podmínek lze identitu distribucí zobecnit na časově závislý případ. Za tímto účelem zavádíme rozdělení přechodových časů vážená produkcí entropie. Zejména ukazujeme, že je možné najít váhu pro každou trajektorii takovou, že vážená rozdělení přechodových časů, vyplývající z těchto vah, jsou identické. Speciální případ periodického...cs_CZ
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakultacs_CZ
dc.subjecttransition times|first-passage problem|transition state theory|Brownian motion|entropy production|double-well potentialen_US
dc.subjectdoby trvaní přechodových jevů|problém prvního průchodu|teorie přechodového stavu|Brownův pohyb|produkce entropie|dvojjámový potenciálcs_CZ
dc.titleEntropy production and irreversibility in transition state theoryen_US
dc.typebakalářská prácecs_CZ
dcterms.created2021
dcterms.dateAccepted2021-09-14
dc.description.departmentDepartment of Macromolecular Physicsen_US
dc.description.departmentKatedra makromolekulární fyzikycs_CZ
dc.description.facultyMatematicko-fyzikální fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Mathematics and Physicsen_US
dc.identifier.repId229944
dc.title.translatedEntropie a nevratnost přechodů přes energetické bariérycs_CZ
dc.contributor.refereeNovotný, Tomáš
thesis.degree.nameBc.
thesis.degree.levelbakalářskécs_CZ
thesis.degree.disciplineObecná fyzikacs_CZ
thesis.degree.disciplineGeneral Physicsen_US
thesis.degree.programFyzikacs_CZ
thesis.degree.programPhysicsen_US
uk.thesis.typebakalářská prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csMatematicko-fyzikální fakulta::Katedra makromolekulární fyzikycs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Mathematics and Physics::Department of Macromolecular Physicsen_US
uk.faculty-name.csMatematicko-fyzikální fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Mathematics and Physicsen_US
uk.faculty-abbr.csMFFcs_CZ
uk.degree-discipline.csObecná fyzikacs_CZ
uk.degree-discipline.enGeneral Physicsen_US
uk.degree-program.csFyzikacs_CZ
uk.degree-program.enPhysicsen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csNázev práce: Entropie a nevratnost přechodů přes energetické bariéry Autor: Šimon Pajger Katedra: Katedra makromolekulární fyziky Vedoucí bakalářské práce: RNDr. Artem Ryabov, Ph.D., Katedra makromolekulární fyziky Abstrakt: Moderní experimenty zaměřené na studium dob trvání nerovnovážných přechodových dejů poskytují cenné informace o mikroskopické dynamice těchto procesů. Teoreticky jsou výsledky takových experimentů dobře popsány pouze pro systémy, na něž nepůsobí časově závislá vnější síla, kde jednou z nejobecnějších teoretických předpovědí je tvrzení o rovnosti distribucí časů přechodů dopředu a zpět mezi libovolnými dvěma body krajiny volné energie. Nedávno však bylo experimentálně zjištěno, že tato identita může být narušena působením vnější časově závislé síly. V práci teoreticky zkoumáme tuto situaci a diskutujeme, za jakých podmínek lze identitu distribucí zobecnit na časově závislý případ. Za tímto účelem zavádíme rozdělení přechodových časů vážená produkcí entropie. Zejména ukazujeme, že je možné najít váhu pro každou trajektorii takovou, že vážená rozdělení přechodových časů, vyplývající z těchto vah, jsou identické. Speciální případ periodického...cs_CZ
uk.abstract.enTitle: Entropy production and irreversibility in transition state theory Author: Šimon Pajger Department: Department of Macromolecular Physics Supervisor: RNDr. Artem Ryabov, Ph.D., Department of Macromolecular Physics Abstract: Modern experiments focusing on durations of nonequilibrium transi- tions provide valuable information on the underlying microscopic kinetics. Theo- retically, outcomes of such experiments are well understood for time-independent free energy landscapes only. Amongst the most fundamental results in this area belongs an identity of distributions of times of forward and backward transitions between arbitrary two points of a free energy landscape. However, recently it has been experimentally found, that this identity can be broken by an action of external time-dependent force. In the thesis, we explore this situation theo- retically and discuss under which conditions the identity of distributions can be restored. To this end, we introduce distributions of transition times weighted by the entropy production. In particular, we show that it is possible to find weight for each trajectory, such that weighted distributions of transition times resulting from such weights are identical. Assuming an external harmonic time-dependent force, we discuss two experimentally relevant situations. First,...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakulta, Katedra makromolekulární fyzikycs_CZ
thesis.grade.code1
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusO


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV