Show simple item record

Je evoluce genomu předvídatelná? O čem vypovídají opakované adaptace v čeledi brukvovité
dc.contributor.advisorKolář, Filip
dc.creatorBohutínská, Magdalena
dc.date.accessioned2022-04-11T08:59:40Z
dc.date.available2022-04-11T08:59:40Z
dc.date.issued2021
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/147584
dc.description.abstractAdaptace, proces šíření výhodných alel, umožňuje populacím a druhům čelit nepříznivým podmínkám prostředí. Příklady konvergentní adaptace (zde použita jako synonymum k paralelní) ukazují důležitost přírodního výběru pro formování biologické diversity a umožňují zjišťovat, do jaké míry je genetická podstata evoluce předvídatelná. Mnoho nedávných genomických studií odhalilo, že je konvergentní evoluce na úrovni genomu rozšířená. Jenže konkrétní podoba se velmi liší, od odpovědi pomocí stejných molekulárních drah ale různých míst v genomu (funkční konvergence) po opakovanou adaptaci pomocí stejných genů (opětovné použití genů). To vede k otázce, jestli takto variabilní systém umožňuje jakékoliv predikce ohledně mechanismů zodpovědných za konvergentní adaptaci. Spekuluje se, že se způsoby konvergentní adaptace liší podle příbuznosti zkoumaných linií. Jenže tato možná závislost nikdy nebyla testována na jednotném modelovém systému napříč škálou různých příbuzností, a tak se nemohla potvrdit ani ona, ani její možné příčiny. V předkládané PhD práci jsem empiricky zjišťovala jak a proč se genomická konvergence liší s klesající příbuzností. Jako příklad jsem použila konvergentní adaptaci k vnějším (alpinské prostředí) a vnitřním (celogenomová duplikace) podmínkám. Ty jsem studovala v rostlinné modelové...cs_CZ
dc.description.abstractAdaptation, the process of propagation of beneficial mutations, enables populations and species to face changing environmental conditions. Cases of convergent (considered synonym to 'parallel' here) adaptation highlight natural selection's capacity to shape biological diversity, and provide natural replicates to investigate the extent of predictability in the genetic basis of adaptation. Recently, a wealth of genomic studies has identified widespread genomic convergence. However, the evidence has taken many forms, from responses in the same functions but different loci (function-level convergence) down to the precision of repeated adaptation via the same genes (gene reuse), raising a question if such variation can be explained by some unifying force/mechanism. It has been speculated that patterns of genomic convergence differ among studies because the scale of divergence differs from case to case. Yet, this observation has not been tested on a unified model system across a divergence continuum and so underlying factors remain unknown. In my PhD project I conducted an empirical investigation on how and why patterns of genomic convergence change with increasing divergence. To do so, I studied the genomic basis of convergent adaptation to outer (alpine habitats) and inner (whole genome duplication)...en_US
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.titleHow predictable is genome evolution? Insights from convergent adaptations across Brassicaceaeen_US
dc.typedizertační prácecs_CZ
dcterms.created2021
dcterms.dateAccepted2021-08-31
dc.description.departmentDepartment of Botanyen_US
dc.description.departmentKatedra botanikycs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId194629
dc.title.translatedJe evoluce genomu předvídatelná? O čem vypovídají opakované adaptace v čeledi brukvovitécs_CZ
dc.contributor.refereeNovikova, Polina Yu
dc.contributor.refereeHobza, Roman
thesis.degree.namePh.D.
thesis.degree.leveldoktorskécs_CZ
thesis.degree.disciplineBotanikacs_CZ
thesis.degree.disciplineBotanyen_US
thesis.degree.programBotanikacs_CZ
thesis.degree.programBotanyen_US
uk.thesis.typedizertační prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra botanikycs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Botanyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBotanikacs_CZ
uk.degree-discipline.enBotanyen_US
uk.degree-program.csBotanikacs_CZ
uk.degree-program.enBotanyen_US
thesis.grade.csProspěl/acs_CZ
thesis.grade.enPassen_US
uk.abstract.csAdaptace, proces šíření výhodných alel, umožňuje populacím a druhům čelit nepříznivým podmínkám prostředí. Příklady konvergentní adaptace (zde použita jako synonymum k paralelní) ukazují důležitost přírodního výběru pro formování biologické diversity a umožňují zjišťovat, do jaké míry je genetická podstata evoluce předvídatelná. Mnoho nedávných genomických studií odhalilo, že je konvergentní evoluce na úrovni genomu rozšířená. Jenže konkrétní podoba se velmi liší, od odpovědi pomocí stejných molekulárních drah ale různých míst v genomu (funkční konvergence) po opakovanou adaptaci pomocí stejných genů (opětovné použití genů). To vede k otázce, jestli takto variabilní systém umožňuje jakékoliv predikce ohledně mechanismů zodpovědných za konvergentní adaptaci. Spekuluje se, že se způsoby konvergentní adaptace liší podle příbuznosti zkoumaných linií. Jenže tato možná závislost nikdy nebyla testována na jednotném modelovém systému napříč škálou různých příbuzností, a tak se nemohla potvrdit ani ona, ani její možné příčiny. V předkládané PhD práci jsem empiricky zjišťovala jak a proč se genomická konvergence liší s klesající příbuzností. Jako příklad jsem použila konvergentní adaptaci k vnějším (alpinské prostředí) a vnitřním (celogenomová duplikace) podmínkám. Ty jsem studovala v rostlinné modelové...cs_CZ
uk.abstract.enAdaptation, the process of propagation of beneficial mutations, enables populations and species to face changing environmental conditions. Cases of convergent (considered synonym to 'parallel' here) adaptation highlight natural selection's capacity to shape biological diversity, and provide natural replicates to investigate the extent of predictability in the genetic basis of adaptation. Recently, a wealth of genomic studies has identified widespread genomic convergence. However, the evidence has taken many forms, from responses in the same functions but different loci (function-level convergence) down to the precision of repeated adaptation via the same genes (gene reuse), raising a question if such variation can be explained by some unifying force/mechanism. It has been speculated that patterns of genomic convergence differ among studies because the scale of divergence differs from case to case. Yet, this observation has not been tested on a unified model system across a divergence continuum and so underlying factors remain unknown. In my PhD project I conducted an empirical investigation on how and why patterns of genomic convergence change with increasing divergence. To do so, I studied the genomic basis of convergent adaptation to outer (alpine habitats) and inner (whole genome duplication)...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra botanikycs_CZ
thesis.grade.codeP
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusO


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV