Show simple item record

Geometrické standardy nukleových kyselin
dc.contributor.advisorČerný, Jiří
dc.creatorSchramlová, Barbora
dc.date.accessioned2021-06-29T10:02:47Z
dc.date.available2021-06-29T10:02:47Z
dc.date.issued2021
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/126503
dc.description.abstractV Abstrakt Nukleové kyseliny (NA) jsou biochemické makromolekulární látky, nezbytné pro všechny živé organismy - jejich funkcí je uchovávání genetické informace a řízení procesů syntézy bílkovin. Nukleové kyseliny jsou složené z polynukleotidových řetězců a podle složení těchto nukleotidů rozlišujeme dva základní druhy nukleových kyselin: DNA (Deoxyribonukleová kyselina) a RNA (Ribonukleová kyselina). Na základě vnitřní nukleotidové sekvence, a i vlivem vnějších interakcí se tyto řetězce formují do různých prostorových konformací. Na úrovni dinukleotidů jsou tyto konformace popisovány a klasifikovány tzv. třídami dinukleotidových konformerů - NtC. Pro odhalení trojdimenzionálních struktur biologických makromolekul se již přes 50 let používá především metoda rentgenové krystalografie. Principem této metody je interakce rentgenových paprsků s elektronovým oblakem atomů v krystalu. Na základě elektronové hustoty se poté určují atomové pozice. Při rozlišení dostupném u většiny makromolekulárních krystalů však nejsou tyto krystalografická data dostatečná k tomu, aby bylo možné odvodit chemicky přijatelnou strukturu, proto se používají stereochemická omezení. Stereochemické standardy jsou slovníky popisující konkrétní délky vazeb, úhly vazeb, torzní úhly, roviny a chiralitu. Pomocí těchto hodnot se zdokonalují a...cs_CZ
dc.description.abstractIV Abstract Nucleic acids (NA) are biochemical macromolecular substances essential for all living organisms - their function is to store genetic information and control the process of protein biosynthesis. Nucleic acids are composed of polynucleotide chains. According to the composition of these, we distinguish two basic types of nucleic acids: DNA (Deoxyribonucleic Acid) and RNA (Ribonucleic Acid). Based on the internal nucleotide sequence and external interactions, these chains are formed into different spatial conformations. At the dinucleotide level, these conformations are described and classified by so-called classes of dinucleotide conformers - NtC. The X-ray crystallography method has been used for over 50 years to reveal the three- dimensional structures of biological macromolecules. The principle of this is the interaction of X-rays with the electron cloud of atoms in the crystal. Atomic positions are then determined based on the calculated electron density. However, with the resolution available for most macromolecular crystals, these crystallographic data are not sufficient to derive a chemically acceptable structure, so stereochemical restraints apply. Stereochemical restraints are dictionaries describing specific bond lengths, bond angles, torsion angles, planes, and chirality. Using these...en_US
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.titleNucleic Acid Geometry Standardsen_US
dc.typebakalářská prácecs_CZ
dcterms.created2021
dcterms.dateAccepted2021-06-08
dc.description.departmentDepartment of Cell Biologyen_US
dc.description.departmentKatedra buněčné biologiecs_CZ
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId231685
dc.title.translatedGeometrické standardy nukleových kyselincs_CZ
dc.contributor.refereeDohnálek, Jan
thesis.degree.nameBc.
thesis.degree.levelbakalářskécs_CZ
thesis.degree.disciplineBioinformaticsen_US
thesis.degree.disciplineBioinformatikacs_CZ
thesis.degree.programBioinformatikacs_CZ
thesis.degree.programBioinformaticsen_US
uk.thesis.typebakalářská prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra buněčné biologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Cell Biologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBioinformatikacs_CZ
uk.degree-discipline.enBioinformaticsen_US
uk.degree-program.csBioinformatikacs_CZ
uk.degree-program.enBioinformaticsen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csV Abstrakt Nukleové kyseliny (NA) jsou biochemické makromolekulární látky, nezbytné pro všechny živé organismy - jejich funkcí je uchovávání genetické informace a řízení procesů syntézy bílkovin. Nukleové kyseliny jsou složené z polynukleotidových řetězců a podle složení těchto nukleotidů rozlišujeme dva základní druhy nukleových kyselin: DNA (Deoxyribonukleová kyselina) a RNA (Ribonukleová kyselina). Na základě vnitřní nukleotidové sekvence, a i vlivem vnějších interakcí se tyto řetězce formují do různých prostorových konformací. Na úrovni dinukleotidů jsou tyto konformace popisovány a klasifikovány tzv. třídami dinukleotidových konformerů - NtC. Pro odhalení trojdimenzionálních struktur biologických makromolekul se již přes 50 let používá především metoda rentgenové krystalografie. Principem této metody je interakce rentgenových paprsků s elektronovým oblakem atomů v krystalu. Na základě elektronové hustoty se poté určují atomové pozice. Při rozlišení dostupném u většiny makromolekulárních krystalů však nejsou tyto krystalografická data dostatečná k tomu, aby bylo možné odvodit chemicky přijatelnou strukturu, proto se používají stereochemická omezení. Stereochemické standardy jsou slovníky popisující konkrétní délky vazeb, úhly vazeb, torzní úhly, roviny a chiralitu. Pomocí těchto hodnot se zdokonalují a...cs_CZ
uk.abstract.enIV Abstract Nucleic acids (NA) are biochemical macromolecular substances essential for all living organisms - their function is to store genetic information and control the process of protein biosynthesis. Nucleic acids are composed of polynucleotide chains. According to the composition of these, we distinguish two basic types of nucleic acids: DNA (Deoxyribonucleic Acid) and RNA (Ribonucleic Acid). Based on the internal nucleotide sequence and external interactions, these chains are formed into different spatial conformations. At the dinucleotide level, these conformations are described and classified by so-called classes of dinucleotide conformers - NtC. The X-ray crystallography method has been used for over 50 years to reveal the three- dimensional structures of biological macromolecules. The principle of this is the interaction of X-rays with the electron cloud of atoms in the crystal. Atomic positions are then determined based on the calculated electron density. However, with the resolution available for most macromolecular crystals, these crystallographic data are not sufficient to derive a chemically acceptable structure, so stereochemical restraints apply. Stereochemical restraints are dictionaries describing specific bond lengths, bond angles, torsion angles, planes, and chirality. Using these...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra buněčné biologiecs_CZ
thesis.grade.code1
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusO


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV