Show simple item record

RNA analysis of nasopharyngeal swab
dc.contributor.advisorSteiner Mrázová, Lenka
dc.creatorVítková, Magdalena
dc.date.accessioned2021-06-24T09:17:25Z
dc.date.available2021-06-24T09:17:25Z
dc.date.issued2021
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/126307
dc.description.abstractThe nasopharyngeal swab is a very heterogeneous easily available sample which is used to diagnose infectious diseases of the upper respiratory tract. Recently, the swab is increasingly used in biomedical research. The nasopharynx is the place of contact between the external and internal surrounding of an individual and the first immune response to the intrusion of pathogens. Mucosal damage initiates inflammatory and regenerative processes. The nasopharyngeal mucosa is permanently inhabited by a large group of microorganisms which influence the process of the disease. Therefore, the nasopharyngeal swab is a very rich source of host cells and its microbiome. The introduction of the method of massive parallel sequencing, has developed and automated methods for DNA and RNA isolation. It also led to a significant reduction in the cost of their analysis and provides an information about the host genome, the presence of microorganisms and the current level of expression of host and pathogen genes as well. Thanks to the introduction of the single cell sequencing method, it is possible to monitor the interactions of individual cell types under physiological conditions and during the immune response. The aim of this work is to provide an overview of the biological function of the nasopharynx, its cellular...en_US
dc.description.abstractNosohltanový stěr je velmi heterogenní snadno dostupný biologický materiál, který se využívá především k diagnostice infekčních onemocnění horních cest dýchacích. V poslední době je však čím dál více využíván i v biomedicínském výzkumu. Nosohltan je místem styku zevního a vnitřního prostředí jedince, je místem první imunitní odpovědi při vniknutí cizorodých látek či patogenů do dýchacích cest. Poškození sliznice spouští zánětlivé, reparační a regenerační procesy, kterých se účastní celá řada buněk imunitního systému. Sliznice nosohltanu jsou trvale osídleny rozsáhlou skupinou mikroorganismů, které mají vliv na propuknutí a průběh onemocnění. Nosohltanový stěr je tak velmi bohatým zdrojem širokého spektra buněk hostitele a jeho mikrobiomu. Zavedením metody masivního paralelního sekvenování došlo k rozvoji a automatizaci metod izolace DNA a RNA. Dále vedla k výraznému snížení nákladů na jejich analýzu a poskytuje řadu informací o genomu hostitele, zastoupení mikroorganismů, přítomnosti patogenů a také o aktuální výši exprese genů hostitele i patogenu. Díky zavedení metody single cell sekvenování je možné sledovat interakci jednotlivých buněčných typů za fyziologického stavu i během imunitní odpovědi. Cílem práce je poskytnout přehled o biologické funkci nosohltanu, jeho buněčném složení a metod RNA...cs_CZ
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectnasopharynxen_US
dc.subjectmicrobiomeen_US
dc.subjecttranscriptome sequencingen_US
dc.subjectdiagnosisen_US
dc.subjectinfectionen_US
dc.subjectinherited diseasesen_US
dc.subjectnosohltancs_CZ
dc.subjectmikrobiomcs_CZ
dc.subjectsekvenování transkriptomucs_CZ
dc.subjectdiagnostikacs_CZ
dc.subjectinfekcecs_CZ
dc.subjectdědičná onemocněnícs_CZ
dc.titleAnalýza RNA slizničního epitelu nosohltanucs_CZ
dc.typebakalářská prácecs_CZ
dcterms.created2021
dcterms.dateAccepted2021-05-31
dc.description.departmentDepartment of Genetics and Microbiologyen_US
dc.description.departmentKatedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId232407
dc.title.translatedRNA analysis of nasopharyngeal swaben_US
dc.contributor.refereeHojný, Jan
thesis.degree.nameBc.
thesis.degree.levelbakalářskécs_CZ
thesis.degree.disciplineMolekulární biologie a biochemie organismůcs_CZ
thesis.degree.disciplineMolecular Biology and Biochemistry of Organismsen_US
thesis.degree.programSpecial Chemical and Biological Programmesen_US
thesis.degree.programSpeciální chemicko-biologické oborycs_CZ
uk.thesis.typebakalářská prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Genetics and Microbiologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csMolekulární biologie a biochemie organismůcs_CZ
uk.degree-discipline.enMolecular Biology and Biochemistry of Organismsen_US
uk.degree-program.csSpeciální chemicko-biologické oborycs_CZ
uk.degree-program.enSpecial Chemical and Biological Programmesen_US
thesis.grade.csVelmi dobřecs_CZ
thesis.grade.enVery gooden_US
uk.abstract.csNosohltanový stěr je velmi heterogenní snadno dostupný biologický materiál, který se využívá především k diagnostice infekčních onemocnění horních cest dýchacích. V poslední době je však čím dál více využíván i v biomedicínském výzkumu. Nosohltan je místem styku zevního a vnitřního prostředí jedince, je místem první imunitní odpovědi při vniknutí cizorodých látek či patogenů do dýchacích cest. Poškození sliznice spouští zánětlivé, reparační a regenerační procesy, kterých se účastní celá řada buněk imunitního systému. Sliznice nosohltanu jsou trvale osídleny rozsáhlou skupinou mikroorganismů, které mají vliv na propuknutí a průběh onemocnění. Nosohltanový stěr je tak velmi bohatým zdrojem širokého spektra buněk hostitele a jeho mikrobiomu. Zavedením metody masivního paralelního sekvenování došlo k rozvoji a automatizaci metod izolace DNA a RNA. Dále vedla k výraznému snížení nákladů na jejich analýzu a poskytuje řadu informací o genomu hostitele, zastoupení mikroorganismů, přítomnosti patogenů a také o aktuální výši exprese genů hostitele i patogenu. Díky zavedení metody single cell sekvenování je možné sledovat interakci jednotlivých buněčných typů za fyziologického stavu i během imunitní odpovědi. Cílem práce je poskytnout přehled o biologické funkci nosohltanu, jeho buněčném složení a metod RNA...cs_CZ
uk.abstract.enThe nasopharyngeal swab is a very heterogeneous easily available sample which is used to diagnose infectious diseases of the upper respiratory tract. Recently, the swab is increasingly used in biomedical research. The nasopharynx is the place of contact between the external and internal surrounding of an individual and the first immune response to the intrusion of pathogens. Mucosal damage initiates inflammatory and regenerative processes. The nasopharyngeal mucosa is permanently inhabited by a large group of microorganisms which influence the process of the disease. Therefore, the nasopharyngeal swab is a very rich source of host cells and its microbiome. The introduction of the method of massive parallel sequencing, has developed and automated methods for DNA and RNA isolation. It also led to a significant reduction in the cost of their analysis and provides an information about the host genome, the presence of microorganisms and the current level of expression of host and pathogen genes as well. Thanks to the introduction of the single cell sequencing method, it is possible to monitor the interactions of individual cell types under physiological conditions and during the immune response. The aim of this work is to provide an overview of the biological function of the nasopharynx, its cellular...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
thesis.grade.code2
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusO


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV