Retroviral variants and their relationship to nonpermisive cells

Abstract

Ve své doktorské práci jsem se zaměřil na studium obalových glykoproteinů ALV (ptačích leukósových virů), skupiny retrovirů infikující hrabavé ptáky a vyvolávající řadu onemocnění. Informace o způsobech šíření viru, především o jejich receptorech, jsou nezbytné vzhledem k probíhající snaze o eradikaci těchto virů. Navíc, mnoho variant retrovirů infikuje buňky nezávisle na přítomnosti receptoru; pochopení tohoto jevu je rovněž nanejvýš důležité. Analyzovali jsme nově objevenou podskupinu ALV, označenou K pro její sekvenční odlišnost od ostatních podskupin a určili její hostitelský rozsah a interferenci, abychom potvrdili, že si tato skupina zaslouží nové písmeno. Identifikovali jsme receptor pro ALV-K, kterým se ukázal být Tva, receptor využívaný také ALV-A. Vzhledem k rozdílům v hostitelském rozsahu a rozdílné inhibici rozpustnou formou Tva ovšem předpokládáme, že tyto dvě podskupiny využívají rozdílné epitopy Tva receptoru. Také jsme analyzovali variantu ALV-C, vykazující rozšířený hostitelský rozsah, který se projevil její schopnosti infikovat křeččí buňky. Zjistili jsme, že rozšířený hostitelský rozsah koreluje se schopností obalového glykoproteinu přejít do aktivovaného předfúzního stavu předčasně, bez interakce s receptorem, což bylo demonstrováno stejnou citlivostí na teplotu, pH a selektivní...

In my doctoral thesis, I focused on studying the envelope glycoprotein of ALV (Avian Leukosis Viruses), a group of retroviruses infecting Galliformes and inducing a variety of diseases. Eradication of these viruses in the farming industry is in progress and information about the virus spread, namely corresponding receptors, is needed to successfully accomplish this feat. Furthermore, many variants of retroviruses infect cells regardless of the absence of the corresponding receptor, and understanding of this phenomenon is also crucial. We analyzed a newly emerged subgroup of ALV, termed K for its sequence divergence from other subgroups, and determined its host range, interference, and receptor usage, to confirm whether this group deserves a new letter for its designation. We identified a receptor of ALV-K that proved to be Tva, the receptor also used by ALV-A. However, since the K subgroup differs from the A subgroup by its host range and inhibition by the soluble form of Tva, we expect the two subgroups use different epitopes of the Tva receptor. We also analyzed a variant of ALV-C exhibiting an extended host range as it successfully infected hamster cells. We found that the extended host range correlates with the ability of the envelope glycoprotein to acquire activated prefusion state...