Show simple item record

Structural and regulatory aspects of Src kinase activation
dc.contributor.advisorBrábek, Jan
dc.creatorKoudelková, Lenka
dc.date.accessioned2020-10-13T10:03:10Z
dc.date.available2020-10-13T10:03:10Z
dc.date.issued2020
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/121618
dc.description.abstractKináza Src má stěžejní roli v množství fundamentálních buněčných procesů. Mimo jiné je součástí signálních drah řídících proliferaci, motilitu či diferenciaci a často bývá deregulována v různých typech nádorů. Aktivita Src proto podléhá přísné a komplexní regulaci, která je zprostředkována SH3 a SH2 doménami a fosforylačním stavem tyrosinů 416 a 527. V kompaktním inaktivním stavu kinázu udržují intramolekulárními inhibiční interakce. Jejich narušením dochází k otevření struktury Src a přechodu do aktivního stavu. Identifikovali jsme nový mechanismus, skrze který může být Src regulována. Jedná se o fosforylaci konzervovaného tyrosinu 90 vazebného povrchu SH3 domény, která vede ke snížení afinity SH3 domény k ligandům včetně CD linkeru a aktivaci kinázy. Fosfomimikujíci mutace tyrosinu 90 indukovala transformaci buněk a zvýšený invazivní potenciál. Jelikož je katalytická aktivita Src reflektována jeho strukturou, lze prostřednictvím stanovení tvaru kinázy usuzovat na její aktivitu. Na základě této korelace jsme sestrojili FRET senzor konformace Src umožňující sledovat s prostorovým a časovým rozlišením dynamiku aktivace kinázy v buňkách. Dokumentovali jsme, že aktivační mutace v SH3, SH2 i kinázové doméně nebo některé typy inhibitorů jsou schopny vyvolat otevření struktury Src. Analýza aktivace Src...cs_CZ
dc.description.abstractSrc kinase plays a crucial role in a multitude of fundamental cellular processes. Src is an essential component of signalling pathways controlling cellular proliferation, motility or differentiation, and is often found deregulated in tumours. Src activity is therefore maintained under stringent and complex regulation mediated by SH3 and SH2 domains and the phosphorylation state of tyrosines 416 and 527. Active Src adopts an open conformation whereas inactive state of the kinase is characterised by a compact structure stabilised by inhibitory intramolecular interactions. We identified phosphorylation of tyrosine 90 within binding surface of SH3 domain as a new regulatory switch controlling Src kinase activation. Using substitutions mimicking phosphorylation state of the residue we demonstrated that tyrosine 90 phosphorylation controls Src catalytic activity, conformation and interactions mediated by the SH3 domain, representing a positive regulatory mechanism leading to elevated activation of mitogenic pathways and increased invasive potential of cells. Based on correlation between compactness of Src structure and its catalytic activity, we constructed a FRET-based sensor of Src conformation enabling to measure the dynamics of Src activation in cells with spatio-temporal resolution. We found that...en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectSrccs_CZ
dc.subjectSH3 doménacs_CZ
dc.subjectFRET senzorcs_CZ
dc.subjectstrukturacs_CZ
dc.subjectfokální adhezecs_CZ
dc.subjectinvazivitacs_CZ
dc.subjecttransformacecs_CZ
dc.subjectSrcen_US
dc.subjectSH3 domainen_US
dc.subjectFRET sensoren_US
dc.subjectstructureen_US
dc.subjectfocal adhesionsen_US
dc.subjectinvasivenessen_US
dc.subjecttransformationen_US
dc.titleStrukturní a regulační aspekty aktivace kinázy Srccs_CZ
dc.typedizertační prácecs_CZ
dcterms.created2020
dcterms.dateAccepted2020-09-22
dc.description.departmentDepartment of Cell Biologyen_US
dc.description.departmentKatedra buněčné biologiecs_CZ
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId144127
dc.title.translatedStructural and regulatory aspects of Src kinase activationen_US
dc.contributor.refereeBrdička, Tomáš
dc.contributor.refereeHejnar, Jiří
thesis.degree.namePh.D.
thesis.degree.leveldoktorskécs_CZ
thesis.degree.discipline-cs_CZ
thesis.degree.discipline-en_US
thesis.degree.programDevelopmental and Cell Biologyen_US
thesis.degree.programVývojová a buněčná biologiecs_CZ
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.cs-cs_CZ
uk.degree-discipline.en-en_US
uk.degree-program.csVývojová a buněčná biologiecs_CZ
uk.degree-program.enDevelopmental and Cell Biologyen_US
thesis.grade.csProspěl/acs_CZ
thesis.grade.enPassen_US
uk.abstract.csKináza Src má stěžejní roli v množství fundamentálních buněčných procesů. Mimo jiné je součástí signálních drah řídících proliferaci, motilitu či diferenciaci a často bývá deregulována v různých typech nádorů. Aktivita Src proto podléhá přísné a komplexní regulaci, která je zprostředkována SH3 a SH2 doménami a fosforylačním stavem tyrosinů 416 a 527. V kompaktním inaktivním stavu kinázu udržují intramolekulárními inhibiční interakce. Jejich narušením dochází k otevření struktury Src a přechodu do aktivního stavu. Identifikovali jsme nový mechanismus, skrze který může být Src regulována. Jedná se o fosforylaci konzervovaného tyrosinu 90 vazebného povrchu SH3 domény, která vede ke snížení afinity SH3 domény k ligandům včetně CD linkeru a aktivaci kinázy. Fosfomimikujíci mutace tyrosinu 90 indukovala transformaci buněk a zvýšený invazivní potenciál. Jelikož je katalytická aktivita Src reflektována jeho strukturou, lze prostřednictvím stanovení tvaru kinázy usuzovat na její aktivitu. Na základě této korelace jsme sestrojili FRET senzor konformace Src umožňující sledovat s prostorovým a časovým rozlišením dynamiku aktivace kinázy v buňkách. Dokumentovali jsme, že aktivační mutace v SH3, SH2 i kinázové doméně nebo některé typy inhibitorů jsou schopny vyvolat otevření struktury Src. Analýza aktivace Src...cs_CZ
uk.abstract.enSrc kinase plays a crucial role in a multitude of fundamental cellular processes. Src is an essential component of signalling pathways controlling cellular proliferation, motility or differentiation, and is often found deregulated in tumours. Src activity is therefore maintained under stringent and complex regulation mediated by SH3 and SH2 domains and the phosphorylation state of tyrosines 416 and 527. Active Src adopts an open conformation whereas inactive state of the kinase is characterised by a compact structure stabilised by inhibitory intramolecular interactions. We identified phosphorylation of tyrosine 90 within binding surface of SH3 domain as a new regulatory switch controlling Src kinase activation. Using substitutions mimicking phosphorylation state of the residue we demonstrated that tyrosine 90 phosphorylation controls Src catalytic activity, conformation and interactions mediated by the SH3 domain, representing a positive regulatory mechanism leading to elevated activation of mitogenic pathways and increased invasive potential of cells. Based on correlation between compactness of Src structure and its catalytic activity, we constructed a FRET-based sensor of Src conformation enabling to measure the dynamics of Src activation in cells with spatio-temporal resolution. We found that...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra buněčné biologiecs_CZ
thesis.grade.codeP
uk.publication-placePrahacs_CZ


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV