Show simple item record

Biochemical characterization of a model heme sensor protein
dc.contributor.advisorMartínková, Markéta
dc.creatorTajovská, Eva
dc.date.accessioned2020-08-21T13:40:01Z
dc.date.available2020-08-21T13:40:01Z
dc.date.issued2020
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/120046
dc.description.abstractHemoproteins play a lot of important roles within the living organism. One of these being the sensor function - heme sensor proteins are able to detect the changing concentration of heme in organisms. Heme itself serves as a signalling molecule for these proteins. Heme-based gas sensor proteins use a biatomic gas molecule as a signalling molecule. Signal transduction begins once the gas molecule is bound to the heme molecule which is already tightly bound in the protein sensing domain. Both these types of signalling regulate a number of physiological processes in the prokaryotic and eukaryotic organisms. The theoretical part of the bachelor thesis summarizes recent scientific studies on heme sensor proteins, while the experimental part focuses on the properties of a specific model sensor hemoprotein. A direct oxygen sensor from E. coli (EcDOS) was selected as a model protein. Furthermore, the thesis deals with a truncated form of the EcDOS protein, an isolated sensor domain with a PAS structure (EcDOS-PAS). The experimental part aimed at expressing and isolating of both mentioned proteins from E. coli BL-21 (DE3) cells. Finally, both the EcDOS and EcDOS-PAS proteins were preliminarily characterised and their properties compared. The yield of the EcDOS-PAS was several times higher than the yield of...en_US
dc.description.abstractHemoproteiny plní v živém organismu mnoho důležitých rolí. Jednou takovou úlohou je senzorová funkce. Senzorové proteiny, které detekují hem, jsou schopny rozpoznat měnící se koncentraci hemu v daném organismu. Jako signální molekula v případě těchto proteinů slouží samotný hem. Senzorové proteiny, které detekují změny v koncentraci plynů, využívají jako signální molekulu právě biatomickou molekulu plynu. K zahájení přenosu signálu v případě těchto senzorových proteinů dochází po navázání molekuly plynu na molekulu hemu, která je pevně navázána k senzorové doméně proteinu. Oba typy signalizace regulují řadu fyziologických procesů prokaryotických i eukaryotických organismů. V teoretické části této bakalářské práce je uveden souhrn dosavadních poznatků vědeckých studií, které se zabývají hemovými senzorovými proteiny. Experimentální část této práce se zabývá vlastnostmi konkrétního modelového senzorového hemoproteinu. Jedná se o hemoprotein EcDOS, který detekuje kyslík. Dále se tato práce věnuje zkrácené formě tohoto proteinu, izolované senzorové doméně s PAS strukturou (EcDOS-PAS). Úkolem experimentální části této práce bylo oba zmíněné proteiny exprimovat a izolovat z buněk E. coli BL-21 (DE3). Nakonec byly proteiny EcDOS i EcDOS-PAS předběžně charakterizovány a byly porovnány jejich vlastnosti....cs_CZ
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjecthemcs_CZ
dc.subjecthemové senzorové proteinycs_CZ
dc.subjectkyslíkový senzorcs_CZ
dc.subjectpřenos signálucs_CZ
dc.subjecthemeen_US
dc.subjectheme sensor proteinsen_US
dc.subjectoxygen sensorsen_US
dc.subjectsignal transductionen_US
dc.titleBiochemická charakterizace modelového zástupce hemových senzorových proteinůcs_CZ
dc.typebakalářská prácecs_CZ
dcterms.created2020
dcterms.dateAccepted2020-07-29
dc.description.departmentKatedra biochemiecs_CZ
dc.description.departmentDepartment of Biochemistryen_US
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId219487
dc.title.translatedBiochemical characterization of a model heme sensor proteinen_US
dc.contributor.refereeJeřábek, Petr
thesis.degree.nameBc.
thesis.degree.levelbakalářskécs_CZ
thesis.degree.disciplineBiochemiecs_CZ
thesis.degree.disciplineBiochemistryen_US
thesis.degree.programBiochemiecs_CZ
thesis.degree.programBiochemistryen_US
uk.thesis.typebakalářská prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra biochemiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Biochemistryen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBiochemiecs_CZ
uk.degree-discipline.enBiochemistryen_US
uk.degree-program.csBiochemiecs_CZ
uk.degree-program.enBiochemistryen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csHemoproteiny plní v živém organismu mnoho důležitých rolí. Jednou takovou úlohou je senzorová funkce. Senzorové proteiny, které detekují hem, jsou schopny rozpoznat měnící se koncentraci hemu v daném organismu. Jako signální molekula v případě těchto proteinů slouží samotný hem. Senzorové proteiny, které detekují změny v koncentraci plynů, využívají jako signální molekulu právě biatomickou molekulu plynu. K zahájení přenosu signálu v případě těchto senzorových proteinů dochází po navázání molekuly plynu na molekulu hemu, která je pevně navázána k senzorové doméně proteinu. Oba typy signalizace regulují řadu fyziologických procesů prokaryotických i eukaryotických organismů. V teoretické části této bakalářské práce je uveden souhrn dosavadních poznatků vědeckých studií, které se zabývají hemovými senzorovými proteiny. Experimentální část této práce se zabývá vlastnostmi konkrétního modelového senzorového hemoproteinu. Jedná se o hemoprotein EcDOS, který detekuje kyslík. Dále se tato práce věnuje zkrácené formě tohoto proteinu, izolované senzorové doméně s PAS strukturou (EcDOS-PAS). Úkolem experimentální části této práce bylo oba zmíněné proteiny exprimovat a izolovat z buněk E. coli BL-21 (DE3). Nakonec byly proteiny EcDOS i EcDOS-PAS předběžně charakterizovány a byly porovnány jejich vlastnosti....cs_CZ
uk.abstract.enHemoproteins play a lot of important roles within the living organism. One of these being the sensor function - heme sensor proteins are able to detect the changing concentration of heme in organisms. Heme itself serves as a signalling molecule for these proteins. Heme-based gas sensor proteins use a biatomic gas molecule as a signalling molecule. Signal transduction begins once the gas molecule is bound to the heme molecule which is already tightly bound in the protein sensing domain. Both these types of signalling regulate a number of physiological processes in the prokaryotic and eukaryotic organisms. The theoretical part of the bachelor thesis summarizes recent scientific studies on heme sensor proteins, while the experimental part focuses on the properties of a specific model sensor hemoprotein. A direct oxygen sensor from E. coli (EcDOS) was selected as a model protein. Furthermore, the thesis deals with a truncated form of the EcDOS protein, an isolated sensor domain with a PAS structure (EcDOS-PAS). The experimental part aimed at expressing and isolating of both mentioned proteins from E. coli BL-21 (DE3) cells. Finally, both the EcDOS and EcDOS-PAS proteins were preliminarily characterised and their properties compared. The yield of the EcDOS-PAS was several times higher than the yield of...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra biochemiecs_CZ
thesis.grade.code1
uk.publication-placePrahacs_CZ


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV