Helikáza DHX9 a její role ve virových infekcích
Helicase DHX9 and its role in viral life cycles
bakalářská práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/119607Identifikátory
SIS: 219634
Kolekce
- Kvalifikační práce [20134]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Saláková, Martina
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Molekulární biologie a biochemie organismů
Katedra / ústav / klinika
Katedra genetiky a mikrobiologie
Datum obhajoby
9. 7. 2020
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
helikázy, DExD, H-box motiv, DHX9, viry, životní cyklus viruKlíčová slova (anglicky)
helicases, DExD, H-box motif, DHX9, viruses, viral life cycleHelikázy jsou proteiny, které zajišťují odvíjení vláken víceřetězcových konformací nukleových kyselin. DHX9 je zástupcem helikáz s DExD/H motivem. Jako substrát rozeznává molekuly RNA, DNA a hybridní struktury. V jádře eukaryotických buněk se DHX9 účastní vytváření replikační vidličky či působí v komplexu transkripčních faktorů a propojuje jiné proteiny s RNA polymerázou II. Následně DHX9 reguluje posttranskripční úpravy RNA. Po přechodu do cytoplasmy napomáhá správnému průběhu translace strukturovaných mRNA. Vzhledem k tomu, že se DHX9 účastní procesů spojených s nukleovými kyselinami, je zkoumána její úloha v životním cyklu virů. Zároveň je součástí antivirových signalizačních drah buňky. DHX9 poskytuje výhodu RNA virům a retrovirům v jejich replikačním cyklu různými způsoby. Signifikantní je vazba DHX9 na sekundární struktury virových RNA a jejich případná remodelace, která vede k podpoře virové replikace, transkripce i translace. Oproti tomu DNA viry využívají DHX9 k regulaci hostitelské exprese a minimalizaci její antivirové funkce. Pochopení vztahů hostitelských proteinů a virů může vést do budoucna k efektivnějšímu cílení terapeutických preparátů proti virovým infekcím. Klíčová slova: helikázy, DExD/H-box motiv, DHX9, viry, životní cyklus viru
Helicases are proteins that provide strands-unwinding of polystranded conformations of nucleic acids. DHX9 is a representative of helicases with a DExD/H-box motif. It accepts molecules of RNA, DNA and hybrid strucutures as a substrate. Inside the nucleus of the eukaryotic cell, DHX9 participates in the formation of the replication fork or it acts in a complex of trancriptional factors and it connects other proteins with RNA polymerase II. Subsequently DHX9 regulates post-transcritional RNA processing. After a shuttle to the cytoplasm it assists in a correct course of translation of structurated mRNAs. Since DHX9 is involved in nucleic acids-related processes, its role in viral life cycles is investigated. Also it is a part of antiviral signaling pathways of the cell. DHX9 provides an advantage for RNA viruses and retroviruses in their replicative cycle in various manners. The binding of DHX9 on secondary structures of viral RNAs and their eventually remodelation, which causes promotion of viral replication, transcription and translation, is significant. In contrast to that, DNA viruses use DHX9 to regulate host protein expression and minimize its antiviral fuction. Understanding of relationship could lead to more effective aiming of the therapeutic drugs against viral infections. Key words:...