Porovnání metabarcodingu a morfologických přístupů pro analýzu diverzity společenstev protist

Abstract

This thesis is focusing on metabarcoding; its history, principles and current use in science. Metabarcoding brings us a new way to observe a diversity of protists. Although the protists are ubiquitous on the Earth and play a key role in the majority of biological processes, our knowledge of their diversity is still very poor. Traditional microscopy techniques are mostly based on morphology-based identification of taxa. However, they are not so suitable for investigating protist diversity due to their small size, low concentration in the environment, and the convergent morphological evolution of many groups. Similarly, the metabarcoding has its pros and cons, as well. This thesis summarizes pros and cons of both techniques, trying to emphasize the need to both of them to gain a more complete insight into the diversity of protists on the Earth.

Tato práce popisuje metodu metabarcodingu, její historii, princip a současné využití. Jednou z oblastí, ve které metabarcoding umožnil rozvoj poznání, je výzkum diversity protist. I přestože jsou protista na Zemi hojně rozšířená a zastávají mnoho důležitých rolí v ekosystémech, o jejich diverzitě toho příliš mnoho nevíme. Tradiční mikroskopické techniky založené především na určování druhů podle jejich morfologie nejsou vždy pro studium protist úplně vhodné vzhledem k jejich malé velikosti, nízké koncentraci jedinců v prostředí a konvergentní morfologické evoluci u některých skupin. Stejně jako tradiční mikroskopické techniky, i metoda metabarcodingu má své výhody a nevýhody. Tato práce přináší porovnání výhod a nevýhod metabarcodingu a mikroskopických technik pro určování diverzity protist a snaží se zdůraznit potřebu, proč bychom měli při výzkumu použít obou těchto metod.