Show simple item record

Mezidruhový polymorfismus vybraných genů vrozené imunity u sýkor (Paridae)
dc.contributor.advisorVinkler, Michal
dc.creatorTěšický, Martin
dc.date.accessioned2021-03-26T16:43:00Z
dc.date.available2021-03-26T16:43:00Z
dc.date.issued2016
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/117175
dc.description.abstractToll-like receptory jsou geneticky variabilní molekuly vrozené imunity obratlovců, které rozpoznávají tzv. struktury nebezpečí, např. struktury patogenů. Vyšetření genetické variability u TLRs může poodhalit obecné adaptace imunitního systému hostitelů proti tlaku parazitů na molekulární úrovni. Koncept mezidruhového polymorfismu (TSP) předpokládá, že několik identických alel či alelických linií je zděděno od společného předka druhů druhy dceřinými, u nichž následně mohou být dlouhodobě udržovány v polymorfním stavu. Zatímco u genů získané imunity je TSP dobře prostudován, naše znalosti o TSP v genech vrozené imunity, např. TLRs, u nichž bychom mohli TSP předpokládat, jsou nedostatečné. V této práci se proto zaměřuji na popis genetického polymorfismu ve funkčně významných oblastech TLR4 a TLR5 u 192 jedinců 20 druhů sýkor z čeledi sýkorovitých (Paridae). Tyto receptory vážou převážně bakteriální ligandy (TLR4 rozpoznává lipopolysacharid a TLR5 flagelin) a podílejí se tak na prvotní aktivaci imunity proti bakteriálním patogenům. Pro odlišení případného TSP od sdíleného polymorfismu způsobeného genovým tokem byly osekvenovány také introny šesti autosomálních neutrálních markerů. Ze získaných dat vyplývá TLRs jsou variabilní na vnitrodruhové a mezidruhové úrovni u sýkorovitých. Pozitivní selekce byla...cs_CZ
dc.description.abstractAdaptation of host receptor system to optimal detection of infection-related structures is one of the key evolutionary challenges of immunity in host-pathogen interactions. Toll-like receptors (TLRs) are genetically variable molecules of vertebrate innate immunity that recognise danger signals, e.g. pathogenic molecules. Examination of genetic variation in TLRs may reveal mechanisms of host immunity adaptation to pathogenic pressure at molecular level. Trans-species polymorphism (TSP) is a phenomenon which assumes that several identical alleles or allelic lineages are inherited from ascendant to descendant species and these may be subsequently maintained over a long period of time in a polymorphic state. Whereas in adaptive immune genes the concept of TSP is well understood, little is presently known about TSP in innate immune genes such as TLRs. In this thesis I describe genetic polymorphism in functionally-relevant regions of TLR4 and TLR5 in 192 individuals representing 20 species Paridae family (tits, chickadees and titmice). These two receptors bind mainly bacterial ligands (TLR4 detects lipopolysaccharide and TLR5 detects flagellin), being among the first ones to trigger immune response to bacterial pathogens. To differentiate presumed TSP from gene flow among species, intron sequences of six...en_US
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectimmune genesen_US
dc.subjectinnate immunityen_US
dc.subjectintrogressionen_US
dc.subjectselectionen_US
dc.subjectshared variabilityen_US
dc.subjectTLR4en_US
dc.subjectTLR5en_US
dc.subjecttrans-species polymorphismen_US
dc.subjectTSPen_US
dc.subjectimunitní genycs_CZ
dc.subjectintrogresecs_CZ
dc.subjectselekcecs_CZ
dc.subjectsdílená variabilitacs_CZ
dc.subjectTLR4cs_CZ
dc.subjectTLR5cs_CZ
dc.subjecttrans-species polymorfismuscs_CZ
dc.subjectTSPcs_CZ
dc.subjectvrozená imunitacs_CZ
dc.titleTrans-species polymorphism in selected innate immunity genes in tits (Paridae family)en_US
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2016
dcterms.dateAccepted2016-09-13
dc.description.departmentKatedra zoologiecs_CZ
dc.description.departmentDepartment of Zoologyen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId157565
dc.title.translatedMezidruhový polymorfismus vybraných genů vrozené imunity u sýkor (Paridae)cs_CZ
dc.contributor.refereeŠtefka, Jan
dc.identifier.aleph002318295
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineZoologyen_US
thesis.degree.disciplineZoologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra zoologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Zoologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csZoologiecs_CZ
uk.degree-discipline.enZoologyen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csToll-like receptory jsou geneticky variabilní molekuly vrozené imunity obratlovců, které rozpoznávají tzv. struktury nebezpečí, např. struktury patogenů. Vyšetření genetické variability u TLRs může poodhalit obecné adaptace imunitního systému hostitelů proti tlaku parazitů na molekulární úrovni. Koncept mezidruhového polymorfismu (TSP) předpokládá, že několik identických alel či alelických linií je zděděno od společného předka druhů druhy dceřinými, u nichž následně mohou být dlouhodobě udržovány v polymorfním stavu. Zatímco u genů získané imunity je TSP dobře prostudován, naše znalosti o TSP v genech vrozené imunity, např. TLRs, u nichž bychom mohli TSP předpokládat, jsou nedostatečné. V této práci se proto zaměřuji na popis genetického polymorfismu ve funkčně významných oblastech TLR4 a TLR5 u 192 jedinců 20 druhů sýkor z čeledi sýkorovitých (Paridae). Tyto receptory vážou převážně bakteriální ligandy (TLR4 rozpoznává lipopolysacharid a TLR5 flagelin) a podílejí se tak na prvotní aktivaci imunity proti bakteriálním patogenům. Pro odlišení případného TSP od sdíleného polymorfismu způsobeného genovým tokem byly osekvenovány také introny šesti autosomálních neutrálních markerů. Ze získaných dat vyplývá TLRs jsou variabilní na vnitrodruhové a mezidruhové úrovni u sýkorovitých. Pozitivní selekce byla...cs_CZ
uk.abstract.enAdaptation of host receptor system to optimal detection of infection-related structures is one of the key evolutionary challenges of immunity in host-pathogen interactions. Toll-like receptors (TLRs) are genetically variable molecules of vertebrate innate immunity that recognise danger signals, e.g. pathogenic molecules. Examination of genetic variation in TLRs may reveal mechanisms of host immunity adaptation to pathogenic pressure at molecular level. Trans-species polymorphism (TSP) is a phenomenon which assumes that several identical alleles or allelic lineages are inherited from ascendant to descendant species and these may be subsequently maintained over a long period of time in a polymorphic state. Whereas in adaptive immune genes the concept of TSP is well understood, little is presently known about TSP in innate immune genes such as TLRs. In this thesis I describe genetic polymorphism in functionally-relevant regions of TLR4 and TLR5 in 192 individuals representing 20 species Paridae family (tits, chickadees and titmice). These two receptors bind mainly bacterial ligands (TLR4 detects lipopolysaccharide and TLR5 detects flagellin), being among the first ones to trigger immune response to bacterial pathogens. To differentiate presumed TSP from gene flow among species, intron sequences of six...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra zoologiecs_CZ
thesis.grade.code1
dc.contributor.consultantVelová, Hana
dc.contributor.consultantReifová, Radka
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusO
dc.identifier.lisID990023182950106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV