Transcriptomic analysis of cutaneous inflammatory biomarkers in a mouse model of small fiber neuropathy

Abstract

Charles University Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Pharmacology and Toxicology Student: Simona Benčová Supervisors: Dr. Claire Demiot, Dr. Aurore Danigo Assoc. Prof. Přemysl Mladěnka, Ph.D Title of diploma thesis: Transcriptomic analysis of cutaneous inflammatory biomarkers in a mouse model of small fiber neuropathy. Peripheral neuropathy is an expanding public health problem conditioned by various diseases and associated with several adverse effects such as the occurrence of chronic pain or increased risk of pressure ulcers (PUs). The aim of this study is to explore, whether the inflammatory state of the skin is modified during peripheral neuropathy and in the course of the formation of a pressure ulcer. The transcriptomic analysis was performed with two different models of mice: PU model and uninjured model, to determine genes that differ in expression and in particular, those involved in inflammation. Small fiber neuropathy was induced in young mice by intraperitoneal injection of resiniferatoxin (50 µg/kg, i.p.) - transient receptor potential vanilloid 1 (TRPV1) agonist. PUs were induced by applying two magnetic plates on the dorsal skin. Gene expression was obtained based on RNA microarray and the results were subsequently verified by qPCR. The transcriptomic analysis of PU...

Univerzita Karlova Frmaceuticka fakulta v Hradci Králové Katedra farmakológie a toxikológie Študent: Simona Benčová Školitelia: Dr.Claire Demiot, Dr. Aurore Danigo Doc. PharmDr. Přemysl Mladěnka, Ph.D Názov diplomovej práce: Transkriptomická analýza kožných zápalových biomarkerov u myší s neuropatiou malých nervových vlákien. Periférna neuropatia je rozšírujúci sa problém zdravia verejnosti ako následok rôznych ochorení, spojený s niekoľkými nepriaznivými účinkami, ako napríklad výskyt chronickej bolesti či zvýšené riziko vzniku tlakového vredu. Cieľom tejto štúdie je preskúmať, či je zápalový stav kože modifikovaný počas periférnej neuropatie a v priebehu tvorby tlakového vredu. Na dvoch rôznych modeloch myší (myši s tlakovým vredom a myši s nepoškodenou kožou), bola uskutočnená transkriptomická analýza, aby sa určili gény, ktoré sa líšia v expresii a zároveň tie, ktoré sa podieľajú na zápale. Neuropatia malých nervových vlákien bola navodená u mladých myší intraperitoneálnou injekciou resiniferatoxínu (50 μg/kg, i.p), agonistu na vaniloidnom receptore TRPV1. Preležaniny boli spôsobené aplikáciou dvoch magnetických platničiek na koži na chrbte. Na základe RNA mikroarray bola získaná génová expresia a výsledky boli následne overené kvantitatívnou PCR. Transcriptomická analýza kože s tlakovým vredom...