Show simple item record

Inhibitory intramembránových proteas z rodiny rhomboidů jako nástroj buněčné biologie
dc.contributor.advisorStříšovský, Kvido
dc.creatorKuzmík, Ján
dc.date.accessioned2019-10-24T09:52:07Z
dc.date.available2019-10-24T09:52:07Z
dc.date.issued2019
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/111336
dc.description.abstractRhomboid intramembrane serine proteases cleave polypeptide chains within lipid bilayer. Rhomboid proteases were originally discovered in Drosophila melanogaster where they regulate ontogenesis of the fly, but they are present in all domains of life. Nowadays, various diseases, such as malaria, amoebiasis, Parkinson's disease, various tumour malignancies, and diabetes, have been linked with rhomboid proteases. However, natural substrates and function of most rhomboids remain elusive. Cell biology tools are needed for unravelling functions of rhomboids, as well as for potential pharmacological applications, and this together fuels the effort to develop specific rhomboid inhibitors. The inhibitors known to date always bear an electrophilic warhead attacking the nucleophilic serine of the atypical serine-histidine catalytic dyad of rhomboid. From the various developed inhibitors, peptidyl -ketoamides substituted at the ketoamide nitrogen by hydrophobic groups, discovered in our laboratory, hold the biggest potential. They are potent, reversible, selective, tunable, and are built around a pharmacophore already approved for medical use. Here, I set out to improve peptidyl -ketoamides by exploring the chemical space in the active site of rhomboid and testing substituents of the ketoamide nitrogen of increasing...en_US
dc.description.abstractRhomboidní proteázy jsou intramembránové serinové proteázy. Původně byly objeveny jako proteiny důležité pro zárodečný vývoj Drosophily melanogaster, dnes je však známo, že se nachází napříč všemi skupinami organismů a jsou spojovány s řadou významných onemocnění a patogenů. Příkladem je malárie, úplavice, Parkinsonovo onemocnění, řada typů rakoviny či diabetes. Avšak u řady rhomboidních proteáz dosud neznáme jejich přirozené substráty, a tedy ani jejich funkce není často objasněna na molekulární úrovni. Vývoj jejich specifických inhibitorů je důležitý jednak pro jejich využití jako nástrojů buněčné biologie k objasnění role rhomboidních proteáz, ale také pro jejich potenciální využití ve farmakoterapii. Doposud známé inhibitory rhomboidních proteáz jsou charakteristické elektrofilním centrem, které cílí na nukleofilní serin v rámci neobvyklé serin-histidinové katalytické dyády rhomboidů. Zatím největší potenciál vykazují inhibitory v podobě peptidyl -ketoamidů s různými substituenty vázanými na dusík ketoamidové skupiny, které byly dříve vyvinuty v naší laboratoři. Jsou velmi účinné, reverzibilní, selektivní a laditelné. Jejich výhodou je také to, že využívají elektrofilní ketoamidovou skupinu, která je součástí i některých již schválených léčiv. Cílem mé práce bylo pokusit se dále zvýšit účinnost těchto...cs_CZ
dc.languageEnglishcs_CZ
dc.language.isoen_US
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectRhomboid proteaseen_US
dc.subjectintramembrane proteolysisen_US
dc.subjectinhibitor designen_US
dc.subjectpeptidyl ketoamideen_US
dc.subjectGlpGen_US
dc.subjectIntramembránová proteolýzacs_CZ
dc.subjectrhomboidcs_CZ
dc.subjectnávrh inhibitorůcs_CZ
dc.subjectpeptidyl ketoamidecs_CZ
dc.subjectGlpGcs_CZ
dc.titleInhibitors of rhomboid proteases as tools for cell biologyen_US
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2019
dcterms.dateAccepted2019-09-11
dc.description.departmentKatedra buněčné biologiecs_CZ
dc.description.departmentDepartment of Cell Biologyen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId202372
dc.title.translatedInhibitory intramembránových proteas z rodiny rhomboidů jako nástroj buněčné biologiecs_CZ
dc.contributor.refereeHlouchová, Klára
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineImmunologyen_US
thesis.degree.disciplineImunologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra buněčné biologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Cell Biologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csImunologiecs_CZ
uk.degree-discipline.enImmunologyen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csRhomboidní proteázy jsou intramembránové serinové proteázy. Původně byly objeveny jako proteiny důležité pro zárodečný vývoj Drosophily melanogaster, dnes je však známo, že se nachází napříč všemi skupinami organismů a jsou spojovány s řadou významných onemocnění a patogenů. Příkladem je malárie, úplavice, Parkinsonovo onemocnění, řada typů rakoviny či diabetes. Avšak u řady rhomboidních proteáz dosud neznáme jejich přirozené substráty, a tedy ani jejich funkce není často objasněna na molekulární úrovni. Vývoj jejich specifických inhibitorů je důležitý jednak pro jejich využití jako nástrojů buněčné biologie k objasnění role rhomboidních proteáz, ale také pro jejich potenciální využití ve farmakoterapii. Doposud známé inhibitory rhomboidních proteáz jsou charakteristické elektrofilním centrem, které cílí na nukleofilní serin v rámci neobvyklé serin-histidinové katalytické dyády rhomboidů. Zatím největší potenciál vykazují inhibitory v podobě peptidyl -ketoamidů s různými substituenty vázanými na dusík ketoamidové skupiny, které byly dříve vyvinuty v naší laboratoři. Jsou velmi účinné, reverzibilní, selektivní a laditelné. Jejich výhodou je také to, že využívají elektrofilní ketoamidovou skupinu, která je součástí i některých již schválených léčiv. Cílem mé práce bylo pokusit se dále zvýšit účinnost těchto...cs_CZ
uk.abstract.enRhomboid intramembrane serine proteases cleave polypeptide chains within lipid bilayer. Rhomboid proteases were originally discovered in Drosophila melanogaster where they regulate ontogenesis of the fly, but they are present in all domains of life. Nowadays, various diseases, such as malaria, amoebiasis, Parkinson's disease, various tumour malignancies, and diabetes, have been linked with rhomboid proteases. However, natural substrates and function of most rhomboids remain elusive. Cell biology tools are needed for unravelling functions of rhomboids, as well as for potential pharmacological applications, and this together fuels the effort to develop specific rhomboid inhibitors. The inhibitors known to date always bear an electrophilic warhead attacking the nucleophilic serine of the atypical serine-histidine catalytic dyad of rhomboid. From the various developed inhibitors, peptidyl -ketoamides substituted at the ketoamide nitrogen by hydrophobic groups, discovered in our laboratory, hold the biggest potential. They are potent, reversible, selective, tunable, and are built around a pharmacophore already approved for medical use. Here, I set out to improve peptidyl -ketoamides by exploring the chemical space in the active site of rhomboid and testing substituents of the ketoamide nitrogen of increasing...en_US
uk.file-availabilityN
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra buněčné biologiecs_CZ
thesis.grade.code1


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV