Show simple item record

Phenotyping of proteolytic activities enabled by fluorogenic libraries
dc.contributor.advisorMíšek, Jiří
dc.creatorPospíšil, Šimon
dc.date.accessioned2019-10-18T11:18:21Z
dc.date.available2019-10-18T11:18:21Z
dc.date.issued2019
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/110204
dc.description.abstractThis work deals with the preparation of combinatorial libraries of peptides serving as platforms for proteolytic phenotyping. The primary objective was to prepare a solid phase fluorogenic peptide library and screen proteases by fluorescence. Further, the possibility of preparing solid phase DNA-encoded libraries was studied. Due to the non-reactivity of the specific proteases with the solid phase peptides, the solid phase was completely abandoned and DNA-encoded peptide library was prepared in the solution. Using this model of DNA-encoded dipeptide with terminal biotin, the new principle of testing proteolytic activities of proteases was verified. A combinatorial library of DNA-encoded hexapeptides was also prepared. Despite the low yield of the library, the possibility of DNA encoding, the amplifiability of the prepared molecules and the possibility of biotin-based separation were verified. The integrity of the hexapeptide sequence and the protease testing is the subject of further study.en_US
dc.description.abstractTato práce se zabývá přípravou kombinatoriálních knihoven peptidů sloužících jako platformy pro fenotypizaci proteáz. Primárním cílem byla příprava knihovny fluorogenních peptidů na pevné fázi a screening proteáz pomocí fluorescence. Dále byla studována možnost přípravy DNA-kódovaných knihoven na pevné fázi. Z důvodů nereaktivity specifických proteáz s peptidy na pevné fázi byla následně pevná fáze zcela opuštěna a bylo přistoupeno k přípravě DNA-kódované knihovny peptidů v roztoku. Pomocí modelového DNA-kódovaného dipeptidu s terminálním biotinem byl ověřen tento nový princip testování proteolytických aktivit proteáz. Dále byla připravena kombinatoriální knihovna DNA-kódovaných hexapeptidů. I přes nízký výtěžek knihovny byla ověřena možnost DNA kódování, amplifikovatelnost takto připravených molekul a možnost separace na základě biotinu. Integrita hexapeptidové části a testování s proteázami je předmětem dalšího studia.cs_CZ
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.subjectpeptidcs_CZ
dc.subjectfluorescencecs_CZ
dc.subjectsyntéza na pevné fázics_CZ
dc.subjectproteázycs_CZ
dc.subjectpeptide fluorescenceen_US
dc.subjectsolid phase synthesisen_US
dc.subjectproteasesen_US
dc.titleFenotypizace proteolytických aktivit pomocí fluorogenních knihovencs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2019
dcterms.dateAccepted2019-09-16
dc.description.departmentKatedra organické chemiecs_CZ
dc.description.departmentDepartment of Organic Chemistryen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.identifier.repId198628
dc.title.translatedPhenotyping of proteolytic activities enabled by fluorogenic librariesen_US
dc.contributor.refereeHocek, Michal
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineOrganická chemiecs_CZ
thesis.degree.disciplineOrganic Chemistryen_US
thesis.degree.programChemiecs_CZ
thesis.degree.programChemistryen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra organické chemiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Organic Chemistryen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csOrganická chemiecs_CZ
uk.degree-discipline.enOrganic Chemistryen_US
uk.degree-program.csChemiecs_CZ
uk.degree-program.enChemistryen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csTato práce se zabývá přípravou kombinatoriálních knihoven peptidů sloužících jako platformy pro fenotypizaci proteáz. Primárním cílem byla příprava knihovny fluorogenních peptidů na pevné fázi a screening proteáz pomocí fluorescence. Dále byla studována možnost přípravy DNA-kódovaných knihoven na pevné fázi. Z důvodů nereaktivity specifických proteáz s peptidy na pevné fázi byla následně pevná fáze zcela opuštěna a bylo přistoupeno k přípravě DNA-kódované knihovny peptidů v roztoku. Pomocí modelového DNA-kódovaného dipeptidu s terminálním biotinem byl ověřen tento nový princip testování proteolytických aktivit proteáz. Dále byla připravena kombinatoriální knihovna DNA-kódovaných hexapeptidů. I přes nízký výtěžek knihovny byla ověřena možnost DNA kódování, amplifikovatelnost takto připravených molekul a možnost separace na základě biotinu. Integrita hexapeptidové části a testování s proteázami je předmětem dalšího studia.cs_CZ
uk.abstract.enThis work deals with the preparation of combinatorial libraries of peptides serving as platforms for proteolytic phenotyping. The primary objective was to prepare a solid phase fluorogenic peptide library and screen proteases by fluorescence. Further, the possibility of preparing solid phase DNA-encoded libraries was studied. Due to the non-reactivity of the specific proteases with the solid phase peptides, the solid phase was completely abandoned and DNA-encoded peptide library was prepared in the solution. Using this model of DNA-encoded dipeptide with terminal biotin, the new principle of testing proteolytic activities of proteases was verified. A combinatorial library of DNA-encoded hexapeptides was also prepared. Despite the low yield of the library, the possibility of DNA encoding, the amplifiability of the prepared molecules and the possibility of biotin-based separation were verified. The integrity of the hexapeptide sequence and the protease testing is the subject of further study.en_US
uk.file-availabilityV
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra organické chemiecs_CZ
thesis.grade.code1


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV