Show simple item record

Study of (bio)molecular interactions and enzymatic reactions by capillary electrophoretic methods
dc.creatorRůžička, Martin
dc.date.accessioned2021-05-20T12:14:56Z
dc.date.available2021-05-20T12:14:56Z
dc.date.issued2019
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/106877
dc.description.abstractNekovalentní interakce se podílejí na většině procesů v živých organismech. Sílu interakce mezi (bio)molekulami lze charakterizovat pomocí vazebné konstanty příslušných komplexů, k jejímuž stanovení je možno využít řadu fyzikálně-chemických metod. Z nich metody kapilární elektroforézy disponují několika přednostmi: (1) interakce probíhají mezi volnými molekulami ve vodném roztoku bez nutnosti jejich immobilizace, (2) krátká doba analýzy, (3) velmi malá spotřeba zkoumaných molekul, a (4) snadná automatizace analýz. V rámci této disertační práce byly vyvinuty metody afinitní kapilární elektroforézy s částečným plněním (PF-ACE) pro zkoumání interakce mezi oligonukleotidy dvouvláknové DNA a dobře charakterizovaným interkalátorem ethidium bromidem jako modelovou sloučeninou. Následně byly v těchto podmínkách stanoveny vazebné konstanty komplexů oligofenylenových derivátů s DNA oligonukleotidy. Metoda PF-ACE byla optimalizována pro sledování enantioselektivních interakcí mezi helquaty a vybranými chirálními kyselými aromatickými analyty. Bylo identifikováno několik látek, jejich enantiomery byly pomocí helquatů jakožto chirálních selektorů odděleny. Kapilární elektroforéza byla použita jako separační analytická metoda při sledování štěpení peptidových substrátů rhomboidními proteasami. Metoda byla...cs_CZ
dc.description.abstractNon-covalent interactions participate in majority of processes in living organisms. The strength of interaction between (bio)molecules can be characterized by binding constants of respective complexes, which can be determined by variety of physico-chemical methods. From these methods, capillary electrophoresis features several advantages: (1) interactions takes place in aqueous solutions between free molecules without necessity of their immobilization, (2) short analysis time, (3) small consumption of analyzed compounds, and (4) easy automation of analyses. Within this dissertation thesis, methods of partial-filling affinity capillary electrophoresis (PF-ACE) were developed for study of interactions between double-strand DNA oligonucleotides and well characterized intercalator ethidium bromide as a model compound. Subsequently, binding constants of oligophenylene derivatives complexes with DNA oligonucleotides were determined. The PF-ACE method was optimized for study of enantioselective interactions between helquats and selected chiral acidic aromatic analytes. Several compounds whose enantiomers were separated using helquats as chiral selectors were identified. Capillary electrophoresis was applied as a separation analytical method for monitoring of peptide substrate cleavage by rhomboid...en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.titleStudium (bio)molekulových interakcí a enzymových reakcí kapilárními elektroforetickými metodamics_CZ
dc.typerigorózní prácecs_CZ
dcterms.created2019
dcterms.dateAccepted2019-06-07
dc.description.departmentKatedra biochemiecs_CZ
dc.description.departmentDepartment of Biochemistryen_US
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId213582
dc.title.translatedStudy of (bio)molecular interactions and enzymatic reactions by capillary electrophoretic methodsen_US
dc.identifier.aleph002282054
thesis.degree.nameRNDr.
thesis.degree.levelrigorózní řízenícs_CZ
thesis.degree.disciplineBiochemistryen_US
thesis.degree.disciplineBiochemiecs_CZ
thesis.degree.programBiochemistryen_US
thesis.degree.programBiochemiecs_CZ
uk.thesis.typerigorózní prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra biochemiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Biochemistryen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csBiochemiecs_CZ
uk.degree-discipline.enBiochemistryen_US
uk.degree-program.csBiochemiecs_CZ
uk.degree-program.enBiochemistryen_US
thesis.grade.csUznánocs_CZ
thesis.grade.enRecognizeden_US
uk.abstract.csNekovalentní interakce se podílejí na většině procesů v živých organismech. Sílu interakce mezi (bio)molekulami lze charakterizovat pomocí vazebné konstanty příslušných komplexů, k jejímuž stanovení je možno využít řadu fyzikálně-chemických metod. Z nich metody kapilární elektroforézy disponují několika přednostmi: (1) interakce probíhají mezi volnými molekulami ve vodném roztoku bez nutnosti jejich immobilizace, (2) krátká doba analýzy, (3) velmi malá spotřeba zkoumaných molekul, a (4) snadná automatizace analýz. V rámci této disertační práce byly vyvinuty metody afinitní kapilární elektroforézy s částečným plněním (PF-ACE) pro zkoumání interakce mezi oligonukleotidy dvouvláknové DNA a dobře charakterizovaným interkalátorem ethidium bromidem jako modelovou sloučeninou. Následně byly v těchto podmínkách stanoveny vazebné konstanty komplexů oligofenylenových derivátů s DNA oligonukleotidy. Metoda PF-ACE byla optimalizována pro sledování enantioselektivních interakcí mezi helquaty a vybranými chirálními kyselými aromatickými analyty. Bylo identifikováno několik látek, jejich enantiomery byly pomocí helquatů jakožto chirálních selektorů odděleny. Kapilární elektroforéza byla použita jako separační analytická metoda při sledování štěpení peptidových substrátů rhomboidními proteasami. Metoda byla...cs_CZ
uk.abstract.enNon-covalent interactions participate in majority of processes in living organisms. The strength of interaction between (bio)molecules can be characterized by binding constants of respective complexes, which can be determined by variety of physico-chemical methods. From these methods, capillary electrophoresis features several advantages: (1) interactions takes place in aqueous solutions between free molecules without necessity of their immobilization, (2) short analysis time, (3) small consumption of analyzed compounds, and (4) easy automation of analyses. Within this dissertation thesis, methods of partial-filling affinity capillary electrophoresis (PF-ACE) were developed for study of interactions between double-strand DNA oligonucleotides and well characterized intercalator ethidium bromide as a model compound. Subsequently, binding constants of oligophenylene derivatives complexes with DNA oligonucleotides were determined. The PF-ACE method was optimized for study of enantioselective interactions between helquats and selected chiral acidic aromatic analytes. Several compounds whose enantiomers were separated using helquats as chiral selectors were identified. Capillary electrophoresis was applied as a separation analytical method for monitoring of peptide substrate cleavage by rhomboid...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra biochemiecs_CZ
thesis.grade.codeU
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusU
dc.identifier.lisID990022820540106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV