dc.contributor.advisor | Kamanová, Jana | |
dc.creator | Kincová, Veronika | |
dc.date.accessioned | 2018-10-12T12:36:39Z | |
dc.date.available | 2018-10-12T12:36:39Z | |
dc.date.issued | 2018 | |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.11956/102356 | |
dc.description.abstract | Bakterie rodu Bordetella jsou původci vysoce nakažlivého černého kašle u lidí (B. pertussis, B. parapertussis) nebo respiračních onemocnění u ostatních savců (B. bronchiseptica, B. parapertussis). Jedním z faktorů virulence rodu Bordetella je i sekreční systém typu 3 (T3SS), který slouží k dopravě efektorových proteinů přímo z cytozolu bakterie do cytozolu eukaryotické buňky. Protein BopN je substrátovým proteinem T3SS, jemuž je přisuzována efektorová funkce. Nicméně proteiny homologní proteinu BopN u jiných bakterií zprostředkovávají regulaci hierarchické sekrece skrze T3SS a některé z nich jsou zodpovědné i za inhibici sekrece skrze T3SS v prostředí s 2 mM Ca2+, např. v tělních tekutinách hostitele, pokud ještě nedošlo ke kontaktu bakterie s cílovou buňkou. Tato práce se zabývá funkcí proteinu BopN a rovněž rolí vápenatých iontů v aktivitě T3SS u B. bronchiseptica. Aktivita T3SS v médiu bez vápníku a po přídavku 2 mM vápníku byla stanovena 2 nezávislými metodami. Bylo zjištěno, že 2 mM přídavek vápníku vede ke snížení sekrece T3SS reportéru do média a tato regulace je závislá na přítomnosti proteinu BopN. Podobný vliv vápenatých iontů na sekreci skrze T3SS byl pozorován i pomocí hmotnostní spektrometrie. BopN protein reguloval mobilizaci a sekreci translokátorového proteinu T3SS, BopD. Role... | cs_CZ |
dc.description.abstract | Species of the Bordetella genus cause the highly contagious whooping cough disease in humans (B. pertussis, B. parapertussis) and related respiratory diseases in other mammals (B. bronchiseptica, B. parapertussis). One of the virulence systems of Bordetellae is the type III secretion system (T3SS) employed for translocation of effector proteins directly from bacterial cytosol into the cytosol of host cells. The T3SS protein BopN protein has been categorized as a Bordetella effector protein. Nevertheless, the homologous proteins in other gram-negative bacteria function in establishing the secretion hierarchy through T3SS and some of them block T3SS secretion in high calcium environments before bacteria-host cell contact has been established. In this thesis I examined the function of the BopN protein and the role of calcium ions in T3SS activity of B. bronchiseptica. Two independent methods have been used for determination of T3SS secretion activity. Addition of 2 mM calcium ions into bacterial media decreased secretion of the T3SS reporter, while no such effect was observed in a B. bronchiseptica strain lacking the bopN gene. Mass spectrometry data confirmed the inhibition of T3SS activity in the presence of calcium ions. Enhanced calcium levels resulted in decreased mobilization and secretion of... | en_US |
dc.language | Čeština | cs_CZ |
dc.language.iso | cs_CZ | |
dc.publisher | Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
dc.subject | protein BopN | en_US |
dc.subject | type III secretion system | en_US |
dc.subject | Bordetella bronchiseptica | en_US |
dc.subject | calcium ions | en_US |
dc.subject | homologous recombination | en_US |
dc.subject | reporter system for monitoring of secretion activity | en_US |
dc.subject | mass spectrometry | en_US |
dc.subject | protein BopN | cs_CZ |
dc.subject | sekreční systém typu 3 | cs_CZ |
dc.subject | Bordetella bronchiseptica | cs_CZ |
dc.subject | vápenaté ionty | cs_CZ |
dc.subject | homologní rekombinace | cs_CZ |
dc.subject | reportérový systém pro monitorování sekreční aktivity | cs_CZ |
dc.subject | hmotnostní spektrometrie | cs_CZ |
dc.title | Role proteinu BopN v sekrečním aparátu typu III u bakterií rodu Bordetellae | cs_CZ |
dc.type | diplomová práce | cs_CZ |
dcterms.created | 2018 | |
dcterms.dateAccepted | 2018-09-06 | |
dc.description.department | Katedra genetiky a mikrobiologie | cs_CZ |
dc.description.department | Department of Genetics and Microbiology | en_US |
dc.description.faculty | Faculty of Science | en_US |
dc.description.faculty | Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
dc.identifier.repId | 185437 | |
dc.title.translated | BopN function in the Bordetella type III secretion system | en_US |
dc.contributor.referee | Večerek, Branislav | |
thesis.degree.name | Mgr. | |
thesis.degree.level | navazující magisterské | cs_CZ |
thesis.degree.discipline | Microbiology | en_US |
thesis.degree.discipline | Mikrobiologie | cs_CZ |
thesis.degree.program | Biology | en_US |
thesis.degree.program | Biologie | cs_CZ |
uk.thesis.type | diplomová práce | cs_CZ |
uk.taxonomy.organization-cs | Přírodovědecká fakulta::Katedra genetiky a mikrobiologie | cs_CZ |
uk.taxonomy.organization-en | Faculty of Science::Department of Genetics and Microbiology | en_US |
uk.faculty-name.cs | Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
uk.faculty-name.en | Faculty of Science | en_US |
uk.faculty-abbr.cs | PřF | cs_CZ |
uk.degree-discipline.cs | Mikrobiologie | cs_CZ |
uk.degree-discipline.en | Microbiology | en_US |
uk.degree-program.cs | Biologie | cs_CZ |
uk.degree-program.en | Biology | en_US |
thesis.grade.cs | Výborně | cs_CZ |
thesis.grade.en | Excellent | en_US |
uk.abstract.cs | Bakterie rodu Bordetella jsou původci vysoce nakažlivého černého kašle u lidí (B. pertussis, B. parapertussis) nebo respiračních onemocnění u ostatních savců (B. bronchiseptica, B. parapertussis). Jedním z faktorů virulence rodu Bordetella je i sekreční systém typu 3 (T3SS), který slouží k dopravě efektorových proteinů přímo z cytozolu bakterie do cytozolu eukaryotické buňky. Protein BopN je substrátovým proteinem T3SS, jemuž je přisuzována efektorová funkce. Nicméně proteiny homologní proteinu BopN u jiných bakterií zprostředkovávají regulaci hierarchické sekrece skrze T3SS a některé z nich jsou zodpovědné i za inhibici sekrece skrze T3SS v prostředí s 2 mM Ca2+, např. v tělních tekutinách hostitele, pokud ještě nedošlo ke kontaktu bakterie s cílovou buňkou. Tato práce se zabývá funkcí proteinu BopN a rovněž rolí vápenatých iontů v aktivitě T3SS u B. bronchiseptica. Aktivita T3SS v médiu bez vápníku a po přídavku 2 mM vápníku byla stanovena 2 nezávislými metodami. Bylo zjištěno, že 2 mM přídavek vápníku vede ke snížení sekrece T3SS reportéru do média a tato regulace je závislá na přítomnosti proteinu BopN. Podobný vliv vápenatých iontů na sekreci skrze T3SS byl pozorován i pomocí hmotnostní spektrometrie. BopN protein reguloval mobilizaci a sekreci translokátorového proteinu T3SS, BopD. Role... | cs_CZ |
uk.abstract.en | Species of the Bordetella genus cause the highly contagious whooping cough disease in humans (B. pertussis, B. parapertussis) and related respiratory diseases in other mammals (B. bronchiseptica, B. parapertussis). One of the virulence systems of Bordetellae is the type III secretion system (T3SS) employed for translocation of effector proteins directly from bacterial cytosol into the cytosol of host cells. The T3SS protein BopN protein has been categorized as a Bordetella effector protein. Nevertheless, the homologous proteins in other gram-negative bacteria function in establishing the secretion hierarchy through T3SS and some of them block T3SS secretion in high calcium environments before bacteria-host cell contact has been established. In this thesis I examined the function of the BopN protein and the role of calcium ions in T3SS activity of B. bronchiseptica. Two independent methods have been used for determination of T3SS secretion activity. Addition of 2 mM calcium ions into bacterial media decreased secretion of the T3SS reporter, while no such effect was observed in a B. bronchiseptica strain lacking the bopN gene. Mass spectrometry data confirmed the inhibition of T3SS activity in the presence of calcium ions. Enhanced calcium levels resulted in decreased mobilization and secretion of... | en_US |
uk.file-availability | V | |
uk.publication.place | Praha | cs_CZ |
uk.grantor | Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra genetiky a mikrobiologie | cs_CZ |
thesis.grade.code | 1 | |