Bunková lokalizácia rezistentných proteínov Vga(A)LC a Msr(A) prostredníctvom fluorescenčnej mikroskopie
Subcellular localization of resistant proteins Vga(A)LC and Msr(A) using fluorescence microscopy
Buněčná lokalizace rezistentních proteinů Vga(A)LC a Msr(A) prostřednictvím fluorescenční mikroskopie
diplomová práce (OBHÁJENO)

Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/102320Identifikátory
SIS: 184140
Kolekce
- Kvalifikační práce [20205]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Lichá, Irena
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Mikrobiologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra genetiky a mikrobiologie
Datum obhajoby
6. 9. 2018
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Slovenština
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
ABC proteiny, ARE proteiny, antibiotická rezistence, Vga(A)LC, Msr(A), subcelulárni lokalizace, Staphyloccocus aureus, S. haemolyticusKlíčová slova (anglicky)
ABC proteins, ARE proteins, antibiotic resistance, Vga(A)LC, Msr(A), subcellular localization, Staphylococcus aureus, S. haemolyticusVga(A)LC a Msr(A) jsou klinicky významnými rezistentními proteiny u stafylokoků, které udělují rezistenci k inhibitorům translace. Patří mezi ARE ABC-F podrodinu proteinů, která je součástí ABC transportérů. Narozdíl od typických ABC transportérů, ABC-F proteiny nemají transmembránové domény, které jsou zodpovědné za transport látek přes membránu. Proto pro ně není charakteristická transportní funkce, ale regulační nebo rezistenční funkce. Jejich mechanismus působení na ribozomu byl popsán teprve nedávno, kde tyto proteiny vytěsňují antibiotikum z ribozomu. Stále jsou však některé aspekty jejich funkce neobjasněné. Například to, jaký je význam umístění Vga(A) na membráně, které bylo detekováno v membránové frakci nikoliv v ribozomální. V této práci jsem prostřednictvím fluorescenční mikroskopie pozorovala subcelulární lokalizaci rezistenčních fúzních proteinů Vga(A)LC-mEos2, Vga(A)LC- GFP a Msr(A)- eqFP650 v živých buňkách S. aureus, za různých kultivačních podmínek. Ukázalo se, že Vga(A)LC- GFP i Msr(A)- eqFP650 se vyskytují v ohnisku blízko membrány. V závislosti na ATPázové aktivitě nebo přítomnosti antibiotika se lokalizace Msr(A)- eqFP650 v buňce mění z ohniskové na difuzní, pravděpodobně na ribozomech, což navrhuje hypotézu o duálním mechanismu ARE ABC-F proteinů. Druhým cílem práce bylo...
Vga(A)LC and Msr(A) are clinically significant resistant proteins in staphylococci that confer resistance to translational inhibitors. They belong to ARE ABC-F protein subfamily, which is part of ABC transporters. Unlike typical ABC transporters, ABC-F proteins do not have transmembrane domains that are responsible for the transport of substances through the membrane. Therefore, they do not have characteristic transport function but regulatory or resistance function. Their mechanism of action on the ribosome has been described only recently, where these proteins displace the antibiotic from the ribosome. However, some aspects of their function are still unclear. For example, what is the function of the Vga(A) location on a membrane that has been detected in the membrane fraction but not in the ribosomal. In this work, using fluorescence microscopy, I observed subcellular localization of the Vga(A)LC-mEos2, Vga(A)LC-GFP and Msr(A)-eqFP650 resistant fusion proteins in live cells of S. aureus under different culture conditions . It has been shown that Vga(A)LC-GFP and Msr(A)-eqFP650 occur in a foci near the membrane. Depending on ATPase activity or the presence of an antibiotic, the localization of Msr(A)-eqFP650 in the cell changes from focal to diffuse, presumably on ribosomes, suggesting a...