Genetické markery pro sledování posttransplantačního chimerismu

Abstract

Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biochemických věd Kandidát: Bc. Michaela Řehounková Školitel: doc. PharmDr. Martin Beránek, Ph.D. Název diplomové práce: Genetické markery pro sledování posttransplatačního chimerismu Cíle práce: Zpracování dat pacientů, kteří prodělali alogenní transplantaci krvetvorných buněk v letech 2010 až 2014 ve Fakultní nemocnici Hradec Králové a jejich chimerismus byl sledován na Úseku molekulární biologie v Ústavu klinické biochemie a diagnostiky. Po zpracování dat se studoval možný vztah mezi vybranými klinickými parametry a použitými genetickými markery k vyšetření chimerismu. Na závěr se zhodnotily vlivy vybraných parametrů na úspěšnost léčby a úmrtnost v potransplantačním období. Metody: Pro vyšetření potransplantačního chimerismu byla použita metoda vyšetření lokusů krátkých tandemových repetic (STR), která využívá genetické variability mezi dárcem a příjemcem transplantovaného štěpu. DNA dárce a příjemce je izolována pomocí kolonkové soupravy QIAmp DNA Blood Mini Kit (QIAGEN, SRN), k amplifikaci se využívá souprava AmpFlSTR Identifier Kit (Applied Biosystems, USA) a k separaci kapilární elektroforéza (analyzátor ABI 3130-4, Applied Biosystems, USA) Závěr: Mezi nejinformativnější patřily markery D21S11, D2S1338, THO1, FGA a...

Charles University in Prague Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Biochemical Sciences Candidate: Bc. Michaela Řehounková Supervisor: doc. PharmDr. Martin Beránek, Ph.D. Title of diploma thesis: Genetic markers for monitoring post-transplant chimerism The aims of the thesis: Data processing of patients, who underwent allogenic hematopoietic stem cell transplantation in a period from 2010 to 2014 in University Hospital Hradec Kralove and whose state of chimerism was monitored at the Section of Molecular Biology at the Institute of Clinical Biochemistry and Diagnostics. Consequently, analysis of the possible relationship between selected clinical parameters and used genetic markers for chimerism quantification was carried out after the processing of acquired data. Finally, the possible influence of treatment success and mortality by chosen clinical parameters was evaluated. Methods: Analysis of short tandem repeat loci, which uses genetic variability between donor and recipient of transplanted graft, was employed for quantification of post- transplant chimerism. DNA of donor and recipient was isolated by QIAmp DNA Blood Mini Kit (QIAGEN, Germany), amplified by AmpFlSTR Identifier Kit (Applied Biosystems, USA) and separated by capillary electrophoresis (analyzer ABI 3130-4, Applied...