http://hdl.handle.net/20.500.11956/1902 Faculty of Science Thu, 07 May 2026 16:12:53 GMT 2026-05-07T16:12:53Z https://https://dspace.cuni.cz:443/bitstream/id/003c2ac5-e2b1-4f43-876c-f196e38b1898/ http://hdl.handle.net/20.500.11956/1902 http://hdl.handle.net/20.500.11956/207869 Enhancing Anti-tumor Efficacy and Improving Manufacturing of Chimeric Antigenic Receptor T Cells T-lymfocyty exprimující chimérické antigenní receptory (CAR) představují nový léčebný postup, který je obzvláště účinný proti B-lymfocytárním malignitám, a mění dosavadní paradigma léčby rakoviny. V současné době existuje několik schválených a komerčně dostupných CAR T-lymfocytárních produktů. Nicméně tato léčba je stále neúnosně finančně nákladná. Proto existuje poptávka po nahrazení obzvláště nákladných retrovirových/lenvirových vektorů levnějšími, nevirovými alternativami. Navíc se současný výzkum nadále zaměřuje na další vylepšení CAR T-lymfocytů posílením jejich protinádorových funkcí, expanze a perzistence in vivo. Kromě toho je usilováno o rozšíření spektra antigenů a nemocí proti kterým by byly CAR T lymfocyty použitelné. Tato disertační práce se zabývá výrobou CD19 specifických CAR T-lymfocytů z hlediska použitých cytokinů při kultivaci, vektoru pro genetickou modifikaci, testováním nového konstruktu CARu sekretujícího interleukin (IL)-21 a analýzou CAR T-lymfocytů od pacientů léčených produktem tisagenlecleucel. V rámci této práce byl vyvinut alternativní protokol kultivace CAR T-lymfocytů, nahrazující tradičně používaný IL-2, který způsobuje efektorovou diferenciaci T-lymfocytů. Je založen na cytokinech IL-4 a IL-7, které výrazně podporují přežívání T-lymfocytů, přidání IL-21 pak...; Chimeric antigenic receptor (CAR) T cells are a paradigm-shifting cancer treatment option that is particularly effective against B-cell malignancies. Currently, several approved, commercially available CAR T-cell products exist. Nonetheless, this therapy is still prohibitively expensive. Thereby, there is an incentive to substitute the particularly costly retroviral/lentiviral vectors with cheaper non- viral alternatives. Moreover, ongoing research strives to further improve CAR T cells by enhancing their anti-tumor functions, expansion, and in vivo persistence. Additionally, broadening the spectrum of antigens and diseases of CAR T-cell applicability is highly sought after. This thesis addresses CD19- specific CAR T-cell manufacturing regarding cytokines used for the cultivation and vector for genetic alteration, new interleukin (IL)-21 secreting CAR construct testing, and analysis of CAR T cells from patients treated with tisagenlecleucel. As part of this thesis, an alternative CAR T-cell cultivation protocol was developed. Replacing the traditionally used IL-2, which drives the effector differentiation of T cells, the protocol is based on the strongly pro-survival cytokines IL-4 and IL-7, with IL-21 supporting the stem cell memory-like T-cell phenotype retention and low inhibitory receptor... Thu, 01 Jan 2026 00:00:00 GMT http://hdl.handle.net/20.500.11956/207869 2026-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/20.500.11956/207868 Srovnávací evolučně-vývojová analýza dermálního skeletu paprskoploutvých ryb Dermální skelet tvoří společně s endoskeletem kosterní systém těl obratlovců, účastnící se řady rozličných funkcí, jakými jsou opora, pohyb, ochrana či příjem a zpracování potravy. Sestává z řady elementů, jejichž zastoupení se liší s ohledem na fylogenetickou pozici. U čtyřnožců jsou jimi obvykle pouze dermální kosti lebky a zuby, zatímco u zbylých skupin obratlovců zahrnují navíc šupiny, ploutevní paprsky nebo trny ploutví. Nejstarší dermální skelet pokrýval tělní povrch raných obratlovců před ∼ 470 miliony lety. Nabýval formy masivních štítů kryjících hlavohruď a šupin pokrývajících trup. Na anatomické úrovni sestával tento skelet z odontody - jednotky svou stavbou podobnou zubu - a spodní kosti. V průběhu evoluce obratlovců se odontody z vnějšího povrchu rozšířily také do vnitřních prostor ústní dutiny a hltanu, kde daly vznik zubům. Tato teorie našla podporu v nedávné studii provedené na daniu pruhovaném, ve které se ukázalo, že vnější vrstva pokožky zvaná periderm migruje do vnitřních prostor hltanu, kde je nezbytná pro vývoj zubů. Na zástupci "bazálních" paprskoplutvých ryb - jeseteru malém - a zástupci čtyřnožců - axolotlu mexickém - jsme se rozhodli testovat, zda je vnější periderm nezbytný pro vývoj vnitřních odontod (zubů) v rámci širšího fylogenetického vymezení. Výsledky naší...; The dermal skeleton, together with the endoskeleton, forms the skeletal system of vertebrate bodies, participating in various functions such as support, movement, protection, and food intake and processing. It consists of multiple elements whose occurrence varies according to phylogenetic position. In tetrapods, these are usually only dermal cranial bones and teeth, whereas in other vertebrate groups they additionally include scales, fin rays, or fin spines. The earliest dermal skeleton covered the body surface of early vertebrates ∼ 470 million years ago. It took the form of massive shields covering the head and trunk, and scales covering the body. Anatomically, this skeleton consisted of odontodes - units structurally similar to teeth - and basal bone. During vertebrate evolution, odontodes expanded from the external surface into the oral and pharyngeal cavities, where they gave rise to teeth. Recent research on the zebrafish supported this theory, showing that the outer skin layer called periderm migrates into the pharyngeal cavity, where it is essential for tooth development. Using representatives of "basal" ray-finned fishes, the sterlet sturgeon, and of tetrapods, the Mexican axolotl, we tested whether the external periderm is necessary for the development of internal odontodes (teeth) across... Thu, 01 Jan 2026 00:00:00 GMT http://hdl.handle.net/20.500.11956/207868 2026-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/20.500.11956/205177 The polymeric conjugates as an experimental tool in immunomodulation and immunotherapy (CZ): Imunoterapie zásadně změnila léčbu rakoviny, zejména díky checkpoint inhibitorům, zaměřeným na dráhu PD-1/PD-L1. Ačkoli monoklonální protilátky (mAb) zůstávají klinickým zlatým standardem, jejich širší využití omezuje vysoká cena výroby, imunogenicita a omezená penetrace do nádorové tkáně - což jsou problémy, které si žádají inovativní alternativy. Tato dizertační práce představuje anti-PD-L1 iBodies, novou třídu plně syntetických checkpoint inhibitorů na bázi hydrofilních kopolymerů N-(2 hydroxypropyl)metakrylamidu (HPMA), které jsou konjugovány s WL12-makrocyklickým peptidem, specificky navrženým pro vysoce afinitní vazbu na lidský PD-L1. Tato práce také představuje metodu PD-L1 DIANA (DNA-linked Inhibitor Antibody Assay), platformu pro vysokokapacitní screening, která využívá značení DNA a stanovení pomocí kvantitativní PCR pro citlivou a efektivní identifikaci ligandů z chemických knihoven vážících se na PD-L1. Platformy iBody a DIANA společně tvoří synergické nástroje pro vývoj nové generace imunoterapeutik, přičemž nabízejí plně syntetickou, modulární a škálovatelnou alternativu k protilátkovým checkpoint inhibitorům. Wed, 01 Jan 2025 00:00:00 GMT http://hdl.handle.net/20.500.11956/205177 2025-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/20.500.11956/207861 The role of the Kabul block in the tectonics of Afghanistan Kábulský blok, který je součástí centrálních afghánských bloků, se nachází na rozhraní hlavních litosférických desek, indické, arabské a euroasijské. Kábulský blok je tvořen horninami archaického až neoproterozoického fundamentu, metamorfovanými v amfibolitové až granulitové facii, které jsou překryty paleozoickými a mladšími sekvencemi. Zatímco většina nedávných paleogeografických rekonstrukcí regionu se zaměřuje na alpinské události, související s uzavřením oceánu Neotethys, během nichž se kontinentální fragmenty oddělily od Gondwany a následně byly přičleněny k Eurasii, méně pozornosti bylo věnováno starší, předalpinské historii těchto jednotek. Předalpinský vývoj Kábulského bloku naznačuje možné vazby s některými bloky v Eurasii, stejně jako existenci oceánské sutury Hindúkuše, která se nacházela mezi afghánsko-tádžickým blokem na severu a centrálními afghánskými bloky na jihu. Kábulský blok zaujímá jasně definovanou strukturní pozici vůči okolním teránům, včetně západního Hindúkuše, pod který je nasunut z jihu. Vzhledem k tomu, že západní Hindúkuš je tvořen neoproterozoickými až paleozoickými jednotkami, protínanými převážně triasovými až křídovými granitoidy, je nezbytné přehodnotit jeho metamorfní vývoj ve světle nejnovějších poznatků z oblasti Kábulského bloku. Na základě výsledků naší...; The Kabul Block, part of the Central Afghan Blocks, is situated at the boundary of major lithospheric plates, including the Indian, Arabian, and Eurasian Plates. It comprises amphibolite- to granulite-facies basement units of Archean to Neoproterozoic age, which are overlain or thrust by Paleozoic and younger sequences. While most recent paleogeographic reconstructions of the region focus on Alpine events related to the closure of the Neotethys Ocean, during which continental fragments separated from Gondwana and were later accreted to Eurasia, less attention has been given to the earlier, pre-Alpine history of these blocks. This pre-Alpine evolution may indicate a possible connection of some blocks to Eurasia, as well as the existence of the Hindu Kush oceanic suture between the Afghan-Tajik Block to the north and the Central Afghan Blocks to the south. The Kabul Block occupies a well-defined structural position relative to the surrounding terranes, including the western Hindu Kush, beneath which the Kabul Block is underthrust from the south. Given that the western Hindu Kush consists of Neoproterozoic to Paleozoic basement rocks intruded mainly by Triassic-Cretaceous granitoids, it has become essential to reassess its metamorphic history in light of recent findings from the Kabul Block. Based on... Thu, 01 Jan 2026 00:00:00 GMT http://hdl.handle.net/20.500.11956/207861 2026-01-01T00:00:00Z