https://https://dspace.cuni.cz:443 The DSpace digital repository system captures, stores, indexes, preserves, and distributes digital research material. 2026-04-12T08:22:47Z http://hdl.handle.net/20.500.11956/207707 Mezi urbánní rytmoanalýzou a sémiotikou Metodologické rozpracování rytmoanalytického rámce v případové studii proměny Smíchovského nádraží The presented dissertation aims to elaborate a rhythmanalytical methodology through a case study of the urban transformation of Prague's Smíchov railway station. To this end, it grounds its own rhythmanalytical orientation in the theoretical foundations of urban semiotics and its sociosemiotic strand, examining their mutual compatibility and potential for reciprocal enrichment. The methodological framework is built on the selection of specific methods appropriate to the case at hand and on an analysis of their composition and function within rhythmanalysis. The study introduces an original methodological framework whose contribution lies in a stronger anchoring in empirical material, while retaining the openness of rhythmanalysis and, in particular, the advantages that arise from the plurality and synergic effects of the methods applied. In doing so, it addresses one of the perceived methodological gaps in rhythmanalytical practice. A secondary, parallel objective is the implementation of an original rhythmanalytical research study focused on the rhythmic transformations of a major long-term urban project in its initial phase. Within the applied research, the dissertation develops the concept of rhythmic anchors, formulates categories of the intermittent and transient rhythms, and examines the...; Disertační práce sleduje cíl rozpracování rytmoanalytické metodologie skrze případovou studii urbánní proměny Smíchovského nádraží v Praze. Pro tento účel skrze teoretická východiska zakotvuje vlastní rytmoanalytickou orientaci založenou na urbánní sémiotice a jejím proudu socio-sémiotiky. Zkoumá kompatibilitu obou a jejich vzájemné obohacení. Metodologii zakládá na výběru konkrétních metod pro daný případ, analyzuje jejich skladbu a fungování v rytmoanalýze. Rytmoanalýzu doplňuje o vlastní metodologický rámec jehož přínosem je větší zakotvenost v empirii při zachování otevřené povahy rytmoanalýzy, a zejména výhody pramenící z plurality a synergického efektu užitých metod. Tímto doplňuje jeden z autorem vnímaných metodologických deficitů rytmoanalytické praxe. Sekundárním, souběžným cílem je realizace vlastní rytmoanalytické výzkumné studie sledující rytmické proměny zásadního, dlouhodobého urbánního projektu v jeho počáteční fázi. Během aplikovaného výzkumu zakotvuje vlastní koncept rytmických kotev a kategorie přechodných a přerušovaných rytmů a nahlíží možnosti metody kódování ze sémiotické perspektivy. Vedlejším cílem je rovněž komplexní představení francouzské urbánní sémiotiky a rytmoanalýzy v tuzemském prostředí, autorem vnímané jako dosud nedostatečné. 2026-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/20.500.11956/207706 Population genetics, species delimitation and antifungal resistance in members of the Trichophyton mentagrophytes complex - agents of superficial mycoses The doctoral thesis focuses on the taxonomy of the Trichophyton mentagrophytes/interdigitale complex which includes three closely related species - Trichophyton mentagrophytes, Trichophyton interdigitale, and the recently described Trichophyton indotineae. These fungi are pathogenic dermatophytes that cause superficial mycoses in vertebrates. The phenotypic and genotypic similarity among these taxa complicates reliable identification in clinical practice. As a result, laboratory results are inconsistent, which limits the comparability of epidemiological data. The aim of this doctoral thesis is to clarify and revise the taxonomy of the Trichophyton mentagrophytes/interdigitale complex and, in the context of the globally increasing antifungal resistance, to detect the prevalence of resistant dermatophyte strains in the Czech Republic. In the first publication (I), we investigated correlations between phenotypic characteristics and genotypes of 110 isolates belonging to the T. mentagrophytes/interdigitale complex, using three independent genetic markers: ITS, tef1α, and tubb. In the second publication (II), we expanded the phylogenetic analysis by incorporating high-resolution genomic data, which allowed us to assess both phylogenetic relationships and population structure and thereby obtain a clearer...; Disertační práce se zaměřuje na taxonomii komplexu Trichophyton mentagrophytes/interdigitale, který zahrnuje tři úzce příbuzné druhy - Trichophyton mentagrophytes, Trichophyton interdigitale a nově popsaný druh Trichophyton indotineae. Tyto houby patří mezi patogenní dermatofyty způsobující povrchové mykózy u obratlovců. Fenotypová a genotypová podobnost mezi těmito taxony komplikuje spolehlivou identifikaci v klinické praxi. Výsledkem jsou nekonzistentní laboratorní nálezy, které omezují srovnatelnost epidemiologických dat. Cílem této disertační práce je objasnit a revidovat taxonomii komplexu T. mentagrophytes/interdigitale a v kontextu globálně narůstající antifungální rezistence zjistit prevalenci rezistentních dermatofytů v České republice. V první publikaci (I) jsme zkoumali souvislosti mezi fenotypovými charakteristikami a genotypy u 110 izolátů patřících do komplexu T. mentagrophytes/interdigitale, a to pomocí tří nezávislých genetických markerů: ITS, tef1α a tubb. Ve druhé publikaci (II) jsme rozšířili fylogenetickou analýzu o data z genomového sekvenování ve vysokém rozlišení, což nám umožnilo posoudit fylogenetické vztahy i populační strukturu a získat tak jasnější představu o diverzitě v rámci tohoto druhového komplexu. Ve třetí publikaci (III) jsme provedli prospektivní multicentrickou... 2026-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/20.500.11956/207634 Korelace histopatologických a molekulárně genetických znaků nádorů genitourinárního, gynekologického a hepatobiliárního traktu The dissertation focuses on the biological behavior, morphology, and cytogenetics of selected tumors of the urinary tract, male and female genital systems, and liver. It summarizes the results of four years of research presented in eight publications, six of which were published in international peer-reviewed journals with impact factors, and two in Czech scientific periodicals. The first study describes a rare calcifying nested stromal-epithelial tumor (CNSET) of the liver in two young women. Molecular genetic analysis using next-generation sequencing (NGS) and methylation profiling revealed novel mutations in the WT1 gene, thereby expanding knowledge of the genetic background of these tumors and confirming CNSET as a distinct nosologic entity. The second and third studies address the molecular classification of endometrial carcinomas. In a cohort of 270 cases, we demonstrated the importance of NGS and immunohistochemistry for accurate identification of molecular subgroups and "multiple classifier" carcinomas. These studies confirmed the crucial role of NGS in personalized medicine and routine diagnostics of endometrial carcinomas. The fourth paper analyzes 15 juxtaglomerular cell tumors of the kidney. Through immunohistochemistry, cytogenetics, RNA sequencing, and methylation profiling, we...; Disertační práce se zabývá biologickým chováním, morfologií a cytogenetikou vybraných nádorů močového traktu, mužského a ženského genitálu a jater. Shrnuje výsledky čtyřletého výzkumu prezentovaného v osmi publikacích, z nichž sedm vyšlo v impaktovaných mezinárodních časopisech a jedna v českém odborném periodiku. První práce popisuje vzácný calcifying nested stromal-epithelial tumor (CNSET) jater u dvou mladých žen. Molekulárně-genetická analýza pomocí NGS a metylačního profilování odhalila nové mutace v genu WT1, čímž rozšířila poznání genetického pozadí těchto nádorů a potvrdila jejich zařazení jako samostatné nozologické jednotky. Druhá a třetí publikace se věnují molekulární klasifikaci endometriálních karcinomů. Na souboru 270 případů jsme prokázali význam sekvenování nové generace (NGS) a imunohistochemie v přesné identifikaci jednotlivých molekulárních podskupin a "multiple classifier" karcinomů. Studie potvrdily zásadní roli NGS při personalizované léčbě a v rutinní diagnostice endometriálních karcinomů. Čtvrtá práce analyzuje 15 tumorů z juxtaglomerulárních buněk ledviny. Pomocí imunohistochemie, cytogenetiky, RNA sekvenování a metylačního profilování jsme potvrdili, že jde o samostatnou nádorovou jednotku s rekurentními chromozomálními změnami a aktivací dráhy MAPK-RAS. Pátá studie... 2026-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/20.500.11956/207705 The Digital Literacy of Adolescents CZ: Za posledních třicet let se internet stal ústřední součástí života dospívajících v Evropě. Nabízí příležitosti k učení a participaci, ale zároveň je vystavuje rizikům, jako je škodlivý online obsah a kybernenávist. Aby mohli adolescenti využívat online příležitosti a zároveň tato rizika minimalizovat, potřebují dostatečnou digitální gramotnost, chápanou jako soubor dovedností a znalostí potřebných pro efektivní fungování v digitálním prostředí. Vyšší úroveň digitální gramotnosti je však zároveň spojena s širší a častější online aktivitou, která může zvyšovat pravděpodobnost vystavení rizikům. Většina dosavadních studií přistupuje k digitální gramotnosti jako k jednotnému celku a opírá se o průřezové výzkumy, což omezuje poznání jejích různých dimenzí a vývoje v čase. Tato disertační práce reaguje na uvedené mezery prostřednictvím tří empirických studií vycházejících z teoretického modelu ySKILLS a zaměřuje se na dvě hlavní výzkumné otázky: (RQ1) Jaký je vztah mezi digitální gramotností adolescentů a rodičovskou mediací? (RQ2) Jak souvisí digitální gramotnost adolescentů se záměrným a nezáměrným vystavením se online rizikům? Studie 1 (Journal of Medical Internet Research) využila třívlnná panelová data z České republiky (N = 2 500) a zkoumala vztah mezi rodičovskou e-health mediací a e-health gramotností...; CZ: Za posledních třicet let se internet stal ústřední součástí života dospívajících v Evropě. Nabízí příležitosti k učení a participaci, ale zároveň je vystavuje rizikům, jako je škodlivý online obsah a kybernenávist. Aby mohli adolescenti využívat online příležitosti a zároveň tato rizika minimalizovat, potřebují dostatečnou digitální gramotnost, chápanou jako soubor dovedností a znalostí potřebných pro efektivní fungování v digitálním prostředí. Vyšší úroveň digitální gramotnosti je však zároveň spojena s širší a častější online aktivitou, která může zvyšovat pravděpodobnost vystavení rizikům. Většina dosavadních studií přistupuje k digitální gramotnosti jako k jednotnému celku a opírá se o průřezové výzkumy, což omezuje poznání jejích různých dimenzí a vývoje v čase. Tato disertační práce reaguje na uvedené mezery prostřednictvím tří empirických studií vycházejících z teoretického modelu ySKILLS a zaměřuje se na dvě hlavní výzkumné otázky: (RQ1) Jaký je vztah mezi digitální gramotností adolescentů a rodičovskou mediací? (RQ2) Jak souvisí digitální gramotnost adolescentů se záměrným a nezáměrným vystavením se online rizikům? Studie 1 (Journal of Medical Internet Research) využila třívlnná panelová data z České republiky (N = 2 500) a zkoumala vztah mezi rodičovskou e-health mediací a e-health gramotností... 2026-01-01T00:00:00Z