http://hdl.handle.net/20.500.11956/1902 Faculty of Science 2026-08-29T10:09:07Z http://hdl.handle.net/20.500.11956/211947 Crustacea (Decapoda, Cirripedia) from the Bohemian Cretaceous Basin Předkládaná práce se zabývá systematickou revizí, evolučními trendy, paleoekologií a paleogeografií korýšů ze skupin Decapoda a Cirripedia pocházejících ze svrchní křídy české křídové pánve. Práce je prezentována jako soubor devíti samostatných článků, které byly publikovány v recenzovaných odborných časopisech. V jednotlivých článcích je popisován nejen materiál z muzejních kolekcí, ale i noví jedinci nasbíraní během posledních deseti let. Disertační práce navíc obsahuje i poznámky z článků v přípravě (týká se to rodů Paraclythia a Oncopareia a acrothoracidních svijonožců). Vzhledem k tomu, že korýši z české křídové pánve byli naposledy studováni na přelomu 19. a 20. století (poté částečně revidováni v první polovině 20. století) a od té doby se velmi změnily metody používané v systematice a taxonomii, jsou publikované studie zaměřeny především na moderní popis taxonů. Nedílnou součástí této práce je tak i kapitola o tafonomii a jejím významu při určování fosilních jedinců. Díky moderní revizi byly v článcích popsány nové druhy Ctenocheles fritschi (Decapoda: Axiidea: Ctenochelidae), Archaeochionelasmus nekvasilovae (Cirripedia: Thoracica: Balanomorpha), Myolepas reussi (Cirripedia: Thoracica: Myolepadidae) a Capitulum sklenari (Cirripedia: Thoracica: Pollicipedidae). C. fritschi je jeden z...; This thesis deals with systematic revision, evolutionary trends, palaeoecology and migration patterns of crustaceans (Cirripedia and Decapoda) from the Upper Cretaceous of the Bohemian Cretaceous Basin. Thesis is presented as a compilation of 9 papers that were published in scientific peer-reviewed journals and includes not only old museum material, but also numerous crustacean specimens which have been recovered in the last decade. Besides, short remarks on fossil crustaceans currently under study or in the process of being published (Paraclythia, Oncopareia, Acrothoracica) are also included in this thesis. In view of the fact that the fossil crustaceans from the BCB were most recently recorded in the turn of the 19th and the 20th centuries (and partially revised in the first half of the 20th century) and since the systematics and taxonomy have changed significantly, all papers presented here focus primarily on systematic revision and modern description. The essential part of the thesis thus deals with taphonomy and its bearing on the identification of fossil material. Thanks to a modern description, new species of Ctenocheles fritschi (axiidean shrimp), Archaeochionelasmus nekvasilovae (acorn barnacle), Myolepas reussi and Capitulum sklenari (pedunculate barnacles) were erected. C. fritschi is... 2026-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/20.500.11956/211946 Sphenopterid type of true ferns from Carboniferous basins of Czech massive Tato práce se zabývá sphenopteridními kapradinami z českých karbonských pánví. Práce je předkládaná jako kombinace dvou článků, které byly publikovány ve vědeckých recenzovaných časopisech, jeden článek je v recenzním řízení a poslední článek je připravený k odeslání. Text samotné práce je především úvod obsahující uvedení do problematiky sphenopteridních kapradin a jejich morfologie, dále obsahuje pasáže věnované metodice, studovaným typovým sbírkám, terminologii a výsledkům revize studovaných rodů. Úvod práce slouží jako obecný přehled fosilních kapradin a historie jejich výzkumu. Všechny čtyři články, zde prezentované, jsou zaměřeny na moderní popisy, emendování a revize rodů Boweria Kidston, Dendraena Němejc a Sturia Němejc. Na základě revizí těchto rodů byly popsány následující dva rody: Kidstoniopteris gen.nov. a Paraszea gen. nov. V rámci revize rodu Boweria byl také popsán nový druh Boweria nowarudensis. Pro všechny studované taxony byl použit "celostní přístup", který umožňuje získat co nejvíce informací o kapradině, jak o její morfologii, anatomii, tak reprodukčních orgánech a in situ sporách. Informace o lokalitě a případné zahrnutí petrologických a sedimentárních analýz doplní tato data. Poprvé byly popsány sporangiální buňky jako je annulus, stomium, vrcholové buňky a in situ spory pro...; This thesis deals with the sphenopterid types of ferns from the Czech Carboniferous basins. Thesis is presented as a combination of two published papers in peer-reviewed journals, one manuscript in review and one manuscript ready for submission. The actual text of the thesis is a general introduction with introduction to the study subject of sphenopterid ferns, methodology, studied type collections, terminology and the result of my study. The introduction of the thesis provides a general overview of the ferns and history of their studies. All four papers presented here are focussed on modern redescription, redefinition, emendation and revision of genera Boweria Kidston, Dendraena Němejc, Sturia Němejc. Based on the revision of these genera, following two new genera were established: Kidstoniopteris gen.nov. and Paraszea gen.nov. A new species Boweria nowarudensis has been described during the course of this study. The "whole plant concept" was applied to all studied specimens, which allows to obtain as much information on the ferns morphology, anatomy, and reproductive organs as possible. This was combined with data on in situ spores as well as sedimentological and petrological analyses. The sporangial cells as annulus, stomium and apical cells and in situ spores were described for all genera and... 2026-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/20.500.11956/211969 Individual acoustic monitoring as a tool to study behavioural ecology of a small migratory passerine Sledování jedinců pro vědecké účely je stále z velké části založeno na označování jedinců různými fyzickými značkami. Tato metoda je invazivní a může ovlivnit chování jedinců a potenciálně ohrozit jejich přežití. Individuální akustický monitoring (IAM) umožňuje opakovanou identifikaci jedinců na základě nahrávek jejich individuálně unikátní a stabilní vokalizace, což umožňuje jejich dlouhodobé monitorování bez nutnosti značení. Tato disertační práce představuje čtyři případové studie založené na dlouhodobém sledování modelového druhu, lindušky lesní (Anthus trivialis), prováděném na dvou vzdálených populacích v České republice a ve Velké Británii. Účelem těchto studií je vyhodnotit, za jakých podmínek je vhodné používat IAM, jaké informace může poskytnout a jaké jsou jeho limity. První kapitola zkoumá, zda manipulace spojená s kroužkováním, jako je odchyt, kroužkování nebo odběr krve, má nějaký vliv na dynamiku teritorií a meziroční přežití jedinců. Za tímto účelem studie používá výhradně akusticky monitorované jedince, kteří nebyli dříve manipulováni, jako nezávislou kontrolní skupinu, aby odhalila potenciální dlouhodobé účinky manipulace bez možného zkreslujícího vlivu samotného kroužkování. Mezi manipulovanými a nemanipulovanými samci nebyly zjištěny žádné rozdíly v meziročním přežití nebo...; Traditional individual monitoring methods based on marking of individuals are still commonly used in ecological and behavioural research of animals including birds. However, these methods are invasive and may influence behaviour, detectability or survival of monitored (marked) animals. Individual acoustic monitoring (IAM) enables the repeated identification and long-term monitoring of individuals based solely on recording of their unique and stable vocalisations Using the Tree Pipit (Anthus trivialis) as a model species, this dissertation presents four case studies based on long-term monitoring of two geographically distant populations in the Czech Republic and the United Kingdom. Together, these chapters evaluate some of the conditions under which IAM can be used reliably, the types of information it can provide, and its limitations. Chapter 1 examines the impact of capture, ringing, handling, and blood sampling on territory dynamics and interannual survival. The use of acoustically monitored males that were never captured as an independent control group enables this study to evaluate the potential long-term negative effects of manipulation without the confounding factors of invasive identification methods. No differences were observed in interannual return rates nor in territory dynamic within... 2026-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/20.500.11956/211948 Cadaver-based surveillance of vector-borne bacterial zoonoses in urban ecosystems Členovci přenášení původci onemocnění představují na celém světě významnou hrozbu pro lidské zdraví. Ve střední Evropě patří mezi nejvýznamnější z nich patogeny přenášené klíšťaty, a to nejen kvůli vysoké incidenci a závažnosti působených nemocí, ale také kvůli značnému rozšíření klíštěte Ixodes ricinus a s ním spojenému riziku nákazy nejen v přírodě, ale i v městském prostředí. Znalosti o cirkulaci těchto mikroorganismů u volně žijících živočichů jsou proto z epidemiologického hlediska zcela zásadní. Tato disertační práce se zaměřila na využití kadaverů volně žijících obratlovců adaptovaných na městské prostředí pro monitoring zoonotických bakterií přenášených členovci v urbánních ekosystémech. Kadavery ježků západních (Erinaceus europaeus), ježků východních (E. roumanicus), veverek obecných (Sciurus vulgaris) a kosů černých (Turdus merula) byly použity pro testování pomocí několika real-time PCR protokolů a následných konvenčních PCR metod v kombinaci se sekvenačními analýzami. V rámci předkládané disertační práce byla detekována vysoká prevalence i diverzita zoonotických patogenů, a to zejména z komplexu Borrelia burgdorferi sensu lato, bakterie Anaplasma phagocytophilum, různých druhů bartonel, ale také dalších mikroorganismů, jako jsou Borrelia miyamotoi, Rickettsia helvetica, Spiroplasma spp....; Vector-borne pathogens (VBP) represent an important and continuously emerging threat to human health worldwide. In Central Europe, tick-borne pathogens are among the most significant vector-borne agents due to their high incidence, disease severity, the widespread occurrence of Ixodes ricinus, and the associated risk of tick-borne disease acquisition in both natural and urban environments. Understanding the circulation of these pathogens within wildlife hosts is essential for the VBP epidemiology. This thesis focused on the use of carcasses of synurbic vertebrates as a source of biological material for surveillance of zoonotic vector-borne bacterial pathogens in urban ecosystems. Cadavers of European hedgehogs (Erinaceus europaeus), northern white-breasted hedgehogs (E. roumanicus), Eurasian red squirrels (Sciurus vulgaris), and common blackbirds (Turdus merula) were screened using multiplex real-time PCR and conventional PCR assays combined with sequencing analyses. High prevalence and diversity of zoonotic pathogens were detected, including Borrelia burgdorferi sensu lato genospecies, Borrelia miyamotoi, Bartonella spp., Anaplasma phagocytophilum, Neoehrlichia mikurensis, Rickettsia helvetica, Spiroplasma spp., and Francisella spp. Frequent co-infections and detection of pathogens with different... 2026-01-01T00:00:00Z