Theses http://hdl.handle.net/20.500.11956/1940 2026-07-01T14:51:20Z 2026-07-01T14:51:20Z http://hdl.handle.net/20.500.11956/210025 2026-07-01T09:48:15Z 2026-01-01T00:00:00Z

Didaktický potenciál bezobratlých živočichů ve výuce biologie This bachelor's thesis, drawing on published scientific studies, examines teaching methods focused on invertebrates also on concept of big ideas and evaluates their effectiveness. It also analyzes the potential of this group of organisms for demonstrating natural phenomena in biology education. The thesis further includes a discussion on the use of selected invertebrate species as so-called flagship species, which may contribute to raising awareness of this group of organisms and thereby support biodiversity conservation. It can be concluded that a significant factor influencing both the teaching of invertebrates and the selection of suitable representatives for the role of flagship species is their appearance. Activating teaching methods incorporating elements of scientific inquiry have proven to be particularly effective. At present, the possibilities for employing digital technologies and innovative approaches such as mobile applications and game-based elements are also expanding, contributing to increased student motivation. Given the extraordinary diversity of invertebrates, this group is well suited for demonstrating a wide range of general natural phenomena at the same time, due to the complexity of the topic, the use of overarching conceptual frameworks, such as so-called "big ideas," is...; Tato bakalářská práce se na základě publikovaných vědeckých studií zabývá výukovými metodami zaměřenými na téma bezobratlých živočichů, konceptem velkých myšlenek a hodnotí jejich efektivitu. Zároveň analyzuje potenciál této skupiny organismů pro demonstraci přírodních fenoménů ve výuce biologie. Součástí této práce je rovněž diskuse o využití vybraných druhů bezobratlých jako tzv. flagship species (vlajkových druhů), které mohou přispět ke zvýšení povědomí o této skupině organismů a podpořit tak ochranu biodiverzity. Lze konstatovat, že významným faktorem ovlivňujícím výuku bezobratlých živočichů i výběr vhodných zástupců pro roli vlajkových druhů je jejich vzhled. Velmi efektivní se ukazují být aktivizující výukové metody s prvky vědecké práce. V současnosti se také rozšiřují možnosti využití digitálních technologií a inovativních přístupů například mobilních aplikací a herních prvků, které přispívají ke zvýšení motivace žáků k učení. Vzhledem k mimořádné diverzitě bezobratlých živočichů je tato skupina vhodná pro demonstraci širokého spektra obecných přírodních fenoménů a zároveň pro složitost tématu se doporučuje využití obecných konceptů jako jsou tzv. big ideas (velké myšlenky).

2026-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/20.500.11956/210014 2026-07-01T09:44:32Z 2026-01-01T00:00:00Z

In Silico Analysis of Mammalian Odorant Binding Proteins: Structural Basis and Molecular Mechanisms of Ligand Recognition This thesis investigates mammalian odorant-binding proteins (OBPs) us- ing a combination of computational approaches to understand their evo- lution, structural dynamics, and ligand recognition. First, sequence- and structure-based phylogenetic methods and selection analyses are applied to OBPs and major urinary proteins (MUPs) to explore patterns of diversifi- cation and connect them to their biological functions. Second, molecular metadynamics is employed to examine the structural basis of ligand access to the buried binding cavity and to describe conformational changes associ- ated with pocket opening. Complementing this, deep learning-based confor- mational sampling (BioEmu) is used to explore protein structural variability and to assess its applicability to OBPs. Finally, ligand-binding properties are investigated using virtual screening workflows that combine classical dock- ing, machine-learning-based affinity prediction, and simple physicochemical descriptors.; Tato diplomová práce se zabývá savčími odoranty vázajícími proteiny (OBP) pomocí kombinace in silico výpočetních přístupů s cílem pochopení jejich evoluce, strukturní dynamiky a principů rozpoznávání ligandů. Nej- prve jsou OBP a hlavní močové proteiny (MUP) analyzovány fylogenetic- kými metodami založenými na sekvenčních i strukturních datech, spolu s analýzou selekce, aby byla prozkoumána jejich diverzifikace a její vztah k funkci těchto proteinů. Dále je využita molekulární metadynamika ke studiu principu vstupu ligandů do hluboce skryté vazebné kapsy a k popisu konfor- mačních změn spojených s jejím otevíráním. Dále k analýze konformačního prostoru používáme metodu založenou na hlubokém učení (BioEmu), která slouží k analýze strukturní variability proteinů a posuzujeme zde její použitel- nost pro zkoumání OBP. Nakonec zkoumáme vazbu ligandů pomocí workflow virtuálního screeningu, který kombinuje klasický docking a predikci afinity založenou na strojovém učení.

2026-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/20.500.11956/210009 2026-07-01T09:42:50Z 2026-01-01T00:00:00Z

Standardizace dat objemové aktivity radonu v půdním vzduchu Data standardization of radon activity concentration in soil air Abstract This bachelor's thesis examines the standardization system for measuring soil gas radon concentration (cA), which is one of the parameters used to assess the radon index of a site prior to residential buildings. The thesis pursues two objectives. The first is to describe and evaluate the two-level system for verifying the accuracy of measured data in the Czech Republic, the second is to experimentally verify the stability of cA values during comparative measurements under real geological conditions at radon reference sites. The literature review section summarizes the two-level verification system, whose first level consists of metrological verification of radon measuring instruments and whose second level consists of field testing of measuring organizations at radon reference sites. The experimental part of the thesis assessed the effect of extracting large volumes of soil gas during a comparative measurement involving 17 participating organizations. Statistical analysis of repeated cA measurements taken at the beginning and at the end of the comparative measurement demonstrated, using a paired t-test, that cA values at the Buk reference site remain stable throughout the comparative measurement and show no systematic decline. The...; Standardizace dat objemové aktivity radonu v půdním vzduchu Abstrakt Bakalářská práce se zabývá systémem standardizace dat objemové aktivity radonu (OAR) v půdním vzduchu, který je jedním z parametrů pro posouzení radonového indexu pozemku před výstavbou obytných budov. Práce má dva cíle. Prvním je popis a zhodnocení dvouúrovňového systému ověřování správnosti měřených dat v České republice, druhým experimentální ověření stability hodnot OAR během porovnávacího měření v reálných geologických podmínkách radonových referenčních ploch. Rešeršní část shrnuje dvouúrovňový systém ověřování správnosti měření, jehož první úroveň tvoří metrologické ověření přístrojů pro měření radonu a druhou úroveň terénní testování měřicích organizací na radonových referenčních plochách. V experimentální části práce byl posuzován vliv odsávání velkého objemu půdního vzduchu během porovnávacího měření za účasti 17 testovaných organizací. Statistická analýza dat opakovaných měření OAR na začátku a na konci porovnávacího měření prokázala pomocí párového t-testu, že hodnoty OAR na referenční ploše Buk zůstávají v průběhu porovnávacího měření stabilní a nevykazují systematický pokles. Výsledek jednotlivých organizací při porovnávacím měření tedy není ovlivněn pořadím odběru vzorku půdního vzduchu na referenční ploše.

2026-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/20.500.11956/210002 2026-07-01T09:40:28Z 2026-01-01T00:00:00Z

Fyziologické mechanismy zimního spánku u medvědů rodu Ursus - english Bear winter dormancy is a natural physiological adaptation to periods of food scarcity and adverse environmental conditions. In many respects, it resembles the hibernation observed in small mammals; however, key differences exist between these adaptations. The principal distinctions include only a moderate reduction in body temperature in bears, a different mechanism of thermoregulation, and the ability for rapid reactivation of the organism. Bears employ a range of adaptive mechanisms that allow them to maintain physiological homeostasis despite prolonged immobilization, obesity, and the absence of urination and defecation. Seasonal changes in metabolic, cardiovascular, musculoskeletal, renal, and endocrine systems allow bears to survive unfavorable conditions and may have potential biomedical applications for humans, as mimicking these adaptations could contribute to the treatment of diseases associated with immobilization and obesity. Keywords hibernation, winter dormancy, torpor, bear, thermoregulation, metabolism; Zimní spánek medvědů je přirozená fyziologická adaptace na období nedostatku potravy a nepříznivých environmentálních podmínek. V mnoha ohledech je podobná hibernaci malých savců, ale existují klíčové rozdíly mezi těmito adaptacemi. Hlavními rozdíly jsou pouze mírné snížení tělesné teploty u medvědů, jiný mechanismus termoregulace a schopnost rychlé reaktivace organismu. Organismus medvěda využívá mnoha adaptačních mechanismů, které mu umožňují zůstat v dobrém fyziologickém stavu i přes dlouhé období imobilizace, obezity a nemožnosti močit či defekovat. Sezónní změny v metabolismu, kardiovaskulární, muskuloskeletální, renální či endokrinní oblasti umožňují medvědům přežít nepříznivé podmínky a potenciálně mají biomedicínské využití i pro člověka, jelikož napodobení těchto adaptací může pomoci k léčbě nemocí spojených s imobilizací a obezitou. Klíčová slova hibernace, zimní spánek, torpor, medvěd, termoregulace, metabolismus

2026-01-01T00:00:00Z