Browsing by Advisor "Staněk, David"
Now showing items 1-20 of 27
-
Analýza regulace komplexů cytoplazmatických poly(A) polymeráz
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2011)Date of defense: 22. 9. 2011Regulace genové exprese je dosahováno mnoha způsoby. Výzkum se dlouhá léta zaměřoval především na regulaci genové exprese na úrovni chromatinu, nicméně posttranskripční regulace se na cestě k syntéze proteinů ukazuje být ... -
Assembly and recycling of functional splicing in vivo
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, 1. lékařská fakulta, 2010)Date of defense: 9. 9. 2010 -
Determinants of the splice site selection in protein-coding and long non-coding RNAs
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2019)Date of defense: 14. 3. 2019Ve své dizertační práci jsem se zaměřila na několik málo proskoumaných oblastí regulace sestřihu RNA. V první části jsem analyzovala, jak chromatinové a transkripční regulační elementy mění sestřih pre-mRNA. Ve druhé části ... -
Faktory důležité pro formování Cajalova tělíska
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2012)Date of defense: 31. 5. 2012Tato re er e popisuje strukturu a funkci jaderných domén nazývajících se Cajalova t líska (CB). CB obsahují proteiny a faktory, které se ú astní uspo ádání a modifikace snRNP. Tyto t líska se nachází u obratlovc i bezobratlých ... -
Formation of splicing machinery in the context of the cell nucleus
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2015)Date of defense: 18. 3. 2015Most of the protein coding genes of higher eukaryotes contain introns which have to be removed from primary transcripts to make mRNA which can be used as a template for protein synthesis. This crucial step in the pre-mRNA ... -
Formování sestřihových snRNP v buněčném jádře
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2011)Date of defense: 12. 10. 20111 ABSTRACT There are many structures, suborganelles and bodies in the eukaryotic cell nucleus. These domains provide the nucleus with many specific functions. Nucleolus is specialized compartment serves to ribosomes assembly, ... -
Functional analysis of the TSSC4 chaperone during snRNP formation
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2019)Date of defense: 5. 6. 2019Sestřih je proces, během kterého jsou nekódující sekvence (introny) vystřiženy z pre-mRNA a exony spojeny. Celý tento proces je katalyzován multi-megadaltonovým sestřihovým komplexem, který se skládá z pěti malých jaderných ... -
Hutchinsonův-Gilfordův syndrom progerie - dědičné onemocnění způsobené mutacemi laminu A/C
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2009)Date of defense: 2. 6. 2009 -
m6A RNA methylation in eukaryotic cells
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2019)Date of defense: 4. 6. 2019The N6-methylation of adenosine (m6 A) is the most abundant modification in eukaryotic mRNA. This modification is deposited on RNA co-transcriptionally by the methyltransferase complexes and can also be "erased" by specific ... -
Mapping of SART3 interactions with spliceosomal snRNPs
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2015)Date of defense: 10. 6. 2015Sestřih pre-mRNA je katalyzován obrovským a velmi dynamickým sestřihovým komplexem, který se skládá z pěti malých jaderných ribonukleoproteinových částic (označovaných jako snRNP) a více než stovky dalších proteinů. Biogeneze ... -
Mutations of Splicing Factors in Hereditary Eye Disease - Retinitis Pigmentosa
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2008)Date of defense: 12. 9. 2008 -
Quality control in snRNP biogenesis
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2018)Date of defense: 15. 11. 2018v češtině snRNP patří k nejdůležitějším částem sestřihového komplexu. Jejich životní cyklus se odehrává v cytoplasmě, kde probíhají první fáze jejich biogeneze, a také v jádře, kde plní svoji hlavní funkci. Všechny snRNP ... -
Recyklace sestřihových komplexů
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2013)Date of defense: 10. 6. 2013Ve většině lidských genů jsou kódující úseky (exony) přerušovány dlouhými nekódujícími sekvencemi (introny). Po přepisu genu do pre-mRNA musí být tyto introny velmi přesně vyštěpeny v procesu zvaném sestřih. Sestřih je ... -
Regulace alternativniho sestřihu
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2010)Date of defense: 27. 5. 2010Alternativní sestřih pre-mRNA je důležitým buněčným mechanismem, který umožňuje produkci velkého množství proteinových isoforem z omezeného množství genů. Na regulaci sestřihu alternativních exonů se podílí cis-elementy ... -
Regulace alternativního sestřihu pre-mRNA
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2008)Date of defense: 19. 5. 2008 -
Regulace pre-mRNA sestřihu antisense oligonukleotidy
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2008)Date of defense: 29. 5. 2008 -
REGULACE PRE-mRNA SESTŘIHU V BUNĚČNÉM JÁDŘE
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2006)Date of defense: 19. 9. 2006 -
Regulace pre-mRNA sestřihu v prostředí buněčného jádra
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2011)Date of defense: 12. 10. 2011Eukaryotic genes contain non-coding sequences - introns that are removed during pre-mRNA splicing by the spliceosome. The spliceosome is composed of five snRNPs (U1, U2, U4/U6 and U5) which assemble on pre-mRNA in a step-wise ... -
Regulation of alternative splicing via chromatin modifications
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2014)Date of defense: 20. 3. 2014Alternative splicing (AS) is involved in expansion of transcriptome and proteome during cell growth, cell death, pluripotency, cell differentiation and development. There is increasing evidence to suggest that splicing ... -
The relationship between chromatin organization and RNA splicing
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2010)Date of defense: 10. 6. 2010Je známo, že RNA sestřih a další úpravy pre-mRNA probíhají kotranskripčně. Nedávno bylo velmi nečekaně zjištěno, že některé vlastnosti chromatinu se liší mezi introny a exony, což sestřih přímo propojuje i s organizací ...