Browsing by Advisor "Hampl, Vladimír"
Now showing items 1-20 of 32
-
Anaerobní mitochondriální organely exkavát
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2009)Date of defense: 4. 6. 2009 -
Analyses of Monocercomonoides genome sizes, ploidies and karyotypes
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2019)Date of defense: 22. 2. 2019Oxymonads are a group of flagellate protists living in low oxygen environments - mainly the guts of insects and vertebrates. In this study, we focus on the analysis of ploidy and karyotype of various species of oxymonads ... -
Analýza regulačních oblastí genů v genomu oxymonády Monocercomonoides
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2016)Date of defense: 15. 9. 2016iii Abstrakt Regulace genové exprese je klíčovou schopností každé buňky v jejím vývoji, diferenciaci a v udržování homeostázy. Prozatím je ale dostupných poměrně málo informací o regulaci genové exprese u prvoků a naše ... -
Charakterizace centrinů Euglena gracilis a jejich úloha v metabolii
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2023)Date of defense: 2. 2. 2023Euglena gracilis je jednobuněčný volně žijící sladkovodní bičíkovec řadící se do třídy Euglenida (Euglenozoa, Discoba, Excavata). Synapomorfií skupiny Euglenida je jejich pelikula, pevná vrstva pod povrchem buňky, strukturovaná ... -
The complicated evolution of methionine adenosyltransferase in euglenids and eukaryotes in general
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2015)Date of defense: 21. 1. 2015Many eukaryotic genes do not follow vertical inheritance pattern. In the present work, we have chosen as a model the gene for methionine adenosyltransferase (MAT), in which we have decided to examine in detail the evolutionary ... -
Diverzita prasinofytních řas příbuzných plastidu euglen
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2016)Date of defense: 30. 5. 2016Euglenophyceae představují skupinu jednobuněčných eukaryotických organismů, které v evoluci získaly schopnost fotosyntézy. Jejich plastidy vznikly sekundární endosymbiózou s primární zelenou řasou. Fylogenetické studie ... -
Diverzita rodu Monocercomonoides
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2014)Date of defense: 11. 9. 2014Oxymonády (Excavata, Preaxostyla) jsou skupinou anaerobních endobiotických bičíkovců žijících především ve střevě xylofágního hmyzu (švábi, termiti). V případě rodu Monocercomonoides náležícího do morfologicky nejjednodušší ... -
Evoluce genetického kódu a taxonomie oxymonád
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2012)Date of defense: 19. 9. 2012Oxymonády jsou skupinou heterotrofních bičíkovců žijících v prostředí s nízkou koncentrací kyslíku. Tito prvoci se vyskytují především ve střevě xylofágního hmyzu (švábi, termiti), ale výjimku tvoří rod Monocercomonoides, ... -
Evoluce jaderných a plastidových genomů u euglenidů
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2020)Date of defense: 13. 11. 2020Algae form a diverse group of simple photosynthetic eukaryotes of polyphyletic origin. Algae with a primary plastid (Archaeplastida) acquired it by ingesting cyanobacterium, a prokaryote; algae with a complex plastid ... -
Evolution of euglenid plastid proteome
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2019)Date of defense: 13. 12. 2019Vznik plastidů endosymbiózou a jejich horizontální šíření je široce rozšířený evoluční jev a jedna z významných hnacích sil evoluce eukaryot. Integrace nové organely je doprovázena změnami v její struktuře, genovém obsahu, ... -
Functional study of the SUF pathway in the cell of Monocercomonoides exilis and Paratrimastix pyriformis
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2020)Date of defense: 17. 7. 2020Syntéza železo-sirných center je nepostradatelný buněčný proces, který je závislý na složitých biosyntetických drahách. U modelových eukaryot jsou těmito drahami ISC v mitochondrii a CIA v cytosolu. Nedávná analýza genomu ... -
Fylogenetické postavení rodu Polymastix a jeho prokaryotických symbiontů
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2020)Date of defense: 2. 9. 2020Skupina Polymastigidae je jednou z pěti čeledí oxymonád (Metamonada, Preaxostyla). Zahrnuje drobné bičíkovce obývající trávící trakt hmyzu. V posledních letech byla získána molekulárně-fylogenetická data, která monofyletičnost ... -
Genomics and cell biology of oxymonads
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2019)Date of defense: 13. 12. 2019Oxymonády představují skupinu opomíjených protist žijících jako střevní endosymbionti hmyzu a obratlovců. V této práci jsem se zaměřil na studium fylogeneze, genomiky a buněčné biologie vybraných oxymonád. V rámci práce ... -
Genomics of Preaxostyla flagellates
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2020)Date of defense: 31. 1. 2020Protists inhabiting oxygen-depleted environments have evolved various adaptation to thrive in their niches, including modified mitochondria to various degrees adapted to anaerobiosis. The most radically altered forms of ... -
Intermediate filament proteins of Preaxostyla flagellates
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2023)Date of defense: 29. 5. 20235 Abstract Monocercomonoides exilis and Paratrimastix pyriformis are protists from within the group Preaxostyla (Metamonada), they possess an excavate morphology that is presumed to be an ancestral cytoskeletal organisation ... -
Iron-Sulfur cluster assembly in Monocercomonoides exilis
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2020)Date of defense: 13. 11. 2020Při hledání mitochondrií u oxymonád jsme osekvenovali genom Monocercomonoides exilis - oxymonády izolované ze střeva činčily. Sekvenování poskytlo relativně kompletní genom, který byl důkladně prohledán na geny proteinů ... -
Laterální genový přenos a jeho využití ve fylogenetice eukaryot
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2011)Date of defense: 8. 6. 2011K laterálnímu genovému přenosu dochází u eukaryot relativně vzácně. Proto může být přítomnost konkrétního laterálně přeneseného genu u více linií eukaryot považována za jejich společnou synapomorfii, která je definuje jako ... -
Membránový proteom plastidu euglenidů
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2014)Date of defense: 11. 9. 2014Euglenophyta jsou monofyletická podskupina euglenidů vymezená přítomností zeleného, třemi membránami obaleného plastidu nabytého sekundární endosymbiózou s chlorophytní řasou. Mechanismus, jímž jsou do těchto plastidů ... -
Metabarcoding and environmental sequencing projects
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2023)Date of defense: 25. 5. 2023The thesis explores the use of metabarcoding in projects uncovering biological diversity and its applications in various fields of biology. The thesis provides an overview of the principles and workflow of metabarcoding, ... -
Metoda FISH a její využití v protistologii
Defence status: DEFENDED(Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, 2015)Date of defense: 10. 9. 2015Fluorescenční in situ hybridizace (FISH) je technika, která umožňuje lokalizaci a identifikaci specifické sekvence nukleotidů v DNA, popřípadě RNA, které jsou pak následně viditelné pod mikroskopem. FISH spočívá nejprve v ...